非法经营罪是由人民检察院进行起诉的。以下是对这一问题的详细解释：

1. 起诉主体：

   • 在刑事诉讼中，起诉是人民检察院的职权之一。对于非法经营罪等刑事案件，人民检察院负责审查公安机关移送的案件材料，决定是否提起公诉。

2. 起诉条件：

   • 人民检察院提起公诉的条件主要包括：犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任。对于非法经营罪，这通常意味着需要证明被告人存在未经许可经营专营、专卖物品或其他限制买卖的物品，或者买卖进出口许可证等经营许可证或批准文件，且情节严重，扰乱了市场秩序。

3. 起诉流程：

   • 公安机关在侦查终结后，会将案件移送人民检察院审查起诉。人民检察院在审查过程中，会讯问犯罪嫌疑人，听取辩护人或值班律师、被害人及其诉讼代理人的意见，并审查案件材料。如果认为犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任，人民检察院会向人民法院提起公诉。

4. 特殊情况：

   • 在某些情况下，如果犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解。对于达成和解协议的案件，人民检察院可以依法从宽处理，包括不起诉或提出从宽处罚的建议。但这并不改变非法经营罪原则上由人民检察院起诉的基本规则。

法律建议：

• 如果您或您身边的人涉嫌非法经营罪，建议尽快咨询专业律师，了解案件的具体情况和可能的法律后果。
• 在面对刑事指控时，保持冷静，积极配合调查，同时寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法经营罪情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。因此，非法经营罪的后果是相当严重的，需要引起足够的重视。

如果您有任何关于非法经营罪或其他刑事案件的法律问题，欢迎直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。