三甲医院的合同工在一般情况下是可以担任诊所有限公司的法人的，但需满足一定条件并考虑潜在限制。以下是对此问题的详细分析：
一、法律资格角度
从法律资格的角度来看，担任公司法人（法定代表人）的主要条件是具备完全民事行为能力，且没有因违法犯罪被剥夺政治权利等限制。三甲医院的合同工，只要其具备完全民事行为能力，且没有受到相关法律限制，理论上是可以担任诊所有限公司的法人的。
二、合同与职业限制角度
劳动合同限制：
- 三甲医院与合同工签订的劳动合同中，可能包含有关竞业限制、兼职等条款。如果劳动合同中明确禁止员工在外兼职或担任其他公司的法人，那么该合同工在合同期内可能无法担任诊所有限公司的法人。
- 即便劳动合同中没有明确禁止，但医院作为用人单位，可能基于管理需要或行业规范，对员工的兼职行为有所限制或要求报备。
职业规范与道德：
- 医疗行业有其特殊的职业规范和道德要求。作为三甲医院的合同工，如果同时担任诊所有限公司的法人，可能会引发利益冲突、影响本职工作或损害医院声誉等问题。因此，即便法律上允许，也可能受到行业内部的规范或道德约束。
三、实际操作与建议
审查劳动合同：
- 在考虑担任诊所有限公司法人之前，三甲医院的合同工应仔细审查其与医院签订的劳动合同，特别是有关竞业限制、兼职等条款，确保自己的行为不违反合同约定。
咨询医院意见：
- 鉴于医疗行业的特殊性，建议合同工在决定担任法人前，咨询医院的意见或报备相关情况，以避免潜在的职业风险或纠纷。
了解相关法律法规：
- 除了劳动合同外，合同工还应了解《公司法》、《劳动合同法》等相关法律法规，确保自己的行为符合法律要求。
考虑实际运营情况：
- 担任诊所有限公司的法人不仅涉及法律资格问题，还涉及实际运营和管理能力。合同工应评估自己是否有足够的时间和精力来履行法人职责，并确保诊所的运营符合相关法律法规和行业规范。
总结与建议：三甲医院的合同工在理论上是可以担任诊所有限公司的法人的，但需满足法律资格条件，并考虑劳动合同、职业规范与道德以及实际运营情况等多方面因素。在做出决定前，建议合同工仔细审查劳动合同、咨询医院意见、了解相关法律法规，并评估自己的实际运营和管理能力。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。