在办案过程中发现存在重大瑕疵时，应当采取以下措施来应对和解决：

1. 立即识别并确认瑕疵的性质与影响：

   • 首先，需要明确瑕疵的具体内容，比如是程序上的错误（如未依法告知权利、未按规定取证等），还是实体上的错误（如事实认定不清、法律适用错误等）。
   • 评估瑕疵对案件结果可能产生的影响，包括是否可能导致证据无效、程序违法被撤销、判决结果被改判等。

2. 及时采取补救措施：

   • 程序瑕疵：如果是程序上的瑕疵，如未依法送达法律文书、未保障当事人的诉讼权利等，应尽快按照法定程序进行补正，如重新送达、通知当事人补正材料等。
   • 实体瑕疵：对于实体上的瑕疵，如事实认定不清或法律适用错误，应重新审查证据，必要时进行补充调查或重新鉴定，以确保事实认定的准确性和法律适用的正确性。
   • 内部审查与纠正：在发现瑕疵后，应立即向办案单位或上级机关报告，启动内部审查程序，对瑕疵进行纠正，并防止类似瑕疵的再次发生。

3. 考虑法律后果与应对策略：

   • 评估风险：根据瑕疵的性质和影响，评估案件可能面临的风险，如被撤销、改判或引发行政复议、行政诉讼等。
   • 制定策略：根据评估结果，制定相应的应对策略，如准备申诉材料、准备应诉答辩等，以最大限度地维护当事人的合法权益。
   • 与当事人沟通：及时与当事人沟通，告知瑕疵情况、可能的影响及应对策略，确保当事人对案件进展有充分的了解，并共同商讨应对措施。

4. 遵循法律程序与规定：

   • 在处理瑕疵的过程中，必须严格遵守法律程序和规定，确保所有补救措施都合法合规。
   • 不得采取任何违法手段来掩盖或纠正瑕疵，否则可能面临更严重的法律后果。

5. 预防未来瑕疵的发生：

   • 完善办案流程：对办案流程进行全面审查，找出可能导致瑕疵的环节，并进行完善和优化。
   • 加强培训与教育：提高办案人员的法律素养和业务能力，通过培训和教育增强其对法律程序和规定的理解和遵守。
   • 建立监督机制：建立有效的内部监督机制，对办案过程进行全程监督，确保所有环节都符合法律程序和规定。

示例说明： 假设在一起行政处罚案件中，办案人员未依法告知当事人有申请听证的权利，这构成了程序上的重大瑕疵。在这种情况下，办案单位应立即识别并确认这一瑕疵，然后按照法定程序重新告知当事人听证权利，并询问其是否申请听证。同时，办案单位还应评估这一瑕疵对案件结果可能产生的影响，并制定相应的应对策略，如准备应诉答辩等。此外，办案单位还应完善办案流程，加强培训与教育，建立监督机制，以预防类似瑕疵的再次发生。

总结与建议： 在办案过程中发现重大瑕疵时，应立即识别并确认瑕疵的性质与影响，及时采取补救措施，并考虑法律后果与应对策略。同时，应遵循法律程序与规定，预防未来瑕疵的发生。如果你在办案过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。