结论概述：国企员工配偶有案底，单位不一定会知道。这主要取决于配偶案底的具体情况、单位的管理制度以及是否涉及相关背景调查等多个因素。

详细分析：

1. 配偶案底的具体情况：

   • 如果配偶的案底是公开的，例如因犯罪被判刑并在公开的司法记录中有所体现，那么理论上，如果单位进行深入的背景调查，是有可能发现这一情况的。
   • 如果配偶的案底是非公开的，或者已经通过法律程序进行了封存或消除，那么单位通常无法直接获取这些信息。

2. 单位的管理制度：

   • 国企在招聘或管理员工时，可能会根据岗位性质、安全要求等因素，对员工及其家庭成员的背景进行一定程度的调查。但这种调查通常是有针对性的，并非对所有员工及其配偶都进行全面调查。
   • 如果单位没有明确规定需要对员工配偶的背景进行调查，或者调查范围不包含配偶的案底情况，那么单位通常不会知道员工配偶的案底。

3. 是否涉及相关背景调查：

   • 在某些特殊情况下，如员工涉及国家安全、机密工作等敏感岗位，单位可能会进行更为严格的背景调查，包括员工配偶的案底情况。
   • 如果员工或其配偶主动向单位透露了案底情况，或者单位在某种方式下得知了这一信息，那么单位就会知道员工配偶有案底。

法律建议与后果：

• 法律建议：对于国企员工而言，如果配偶有案底，且担心这一情况可能影响自己的工作，可以主动向单位人力资源部门或相关领导进行咨询，了解单位对于员工配偶背景的具体要求和政策。同时，也可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能面临的法律风险。
• 可能后果：如果单位在不知情的情况下发现了员工配偶的案底，且认为这一情况可能影响员工的工作表现或单位的安全稳定，单位可能会根据内部规定对员工进行相应处理，如调整岗位、解除劳动合同等。但这种情况并非必然发生，具体还需根据单位的规章制度和实际情况来判断。

总结与引导：

国企员工配偶有案底，单位不一定会知道。这取决于多种因素的综合作用。如果您对此有进一步的疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更为详细和专业的法律建议。