结论：针对三人合伙搞钻井，工程款回来后被一人独占的情况，你们可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径来解决纠纷，涉及的部门或机构主要包括调解组织、仲裁委员会或法院。
详细分析：
协商：
- 首先，你们三人可以尝试通过友好协商的方式解决纠纷。毕竟，合伙关系建立在信任和合作的基础上，通过沟通可能能够找到双方都能接受的解决方案。
调解：
- 如果协商无果，你们可以考虑寻求第三方调解组织的帮助。调解组织通常由具有专业知识和经验的人员组成，他们可以帮助你们分析纠纷的原因，提出合理的解决方案，并促使双方达成和解。
- 调解的优势在于程序相对灵活，成本较低，且能够保持双方的关系，避免进一步的法律冲突。
仲裁：
- 如果你们在合伙协议中约定了仲裁条款，或者事后达成了仲裁协议，那么你们可以将纠纷提交给仲裁委员会进行仲裁。
- 仲裁是一种相对快速、保密且具有法律效力的纠纷解决方式。仲裁委员会会根据双方提供的证据和法律规定作出裁决，该裁决对双方均具有约束力。
诉讼：
- 如果协商、调解和仲裁都无法解决纠纷，那么你们可以向法院提起诉讼。
- 在诉讼过程中，法院会依法审理案件，根据事实和法律规定作出判决。如果判决支持你们的诉求，那么独占工程款的一方需要承担相应的法律责任，包括返还工程款、赔偿损失等。
- 诉讼的优势在于具有强制执行力，一旦判决生效，对方必须履行。但诉讼程序相对复杂，成本较高，且可能破坏双方的关系。
建议：
- 在处理此类纠纷时，建议你们首先收集并保存好所有与工程款相关的证据，如合同、发票、付款记录等。这些证据将在协商、调解、仲裁或诉讼过程中发挥重要作用。
- 如果你们对法律程序不熟悉或担心处理不当，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助你们更好地维护自己的权益。
后续行动：
- 根据上述分析，你们可以根据实际情况选择合适的纠纷解决方式。如果决定通过协商或调解解决纠纷，可以主动联系对方或调解组织；如果决定通过仲裁或诉讼解决纠纷，可以准备相关证据并咨询专业律师的意见。
希望这些建议能对你们有所帮助。如果有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。