结论：工程合同让别人代签且最后不承认，这一行为是否违法需视具体情况而定，可能涉及无权代理、表见代理等法律问题，并可能引发合同效力争议及相应的法律责任。
详细分析：
无权代理的情况：
- 如果代签人没有得到被代理人的明确授权，或者授权已经过期、被撤销，那么代签行为就构成无权代理。
- 在无权代理的情况下，如果被代理人（即实际应签署合同的一方）事后不追认该合同，那么该合同对被代理人不发生效力。此时，代签人可能需要承担因无权代理而给对方造成的损失赔偿责任。
表见代理的情况：
- 表见代理是指虽然行为人事实上无代理权，但相对人有理由认为行为人有代理权而与其进行法律行为，其行为的法律后果由被代理人承担的代理。
- 在工程合同代签的场景中，如果代签人虽然无权代理，但相对方（如发包方或承包方）有理由相信代签人有权代理（例如，代签人持有被代理人的授权委托书、介绍信等），且相对方在签订合同时是善意的、无过失的，那么该合同可能被认定为有效，对被代理人产生约束力。此时，如果被代理人事后不承认合同，可能需要承担表见代理的法律后果。
合同效力的争议：
- 无论代签行为是否构成无权代理或表见代理，都可能引发合同效力的争议。如果合同被认定为无效或可撤销，那么双方可能需要就合同无效或可撤销后的法律后果进行协商或诉讼。
- 在这种情况下，代签人、被代理人以及相对方都可能需要承担一定的法律责任，具体责任取决于合同无效或可撤销的原因以及各方的过错程度。
法律建议：
- 对于被代理人而言，应谨慎授权他人代签合同，并确保授权委托书等文件的真实性和有效性。如果发现他人未经授权代签合同，应及时采取措施防止损失扩大，并考虑通过法律途径维护自己的权益。
- 对于相对方而言，在签订合同时应仔细审查对方的授权情况，确保对方有权代表被代理人签署合同。如果发现代签行为存在疑点或风险，应及时与被代理人核实并保留相关证据。
可能引发的法律后果：
- 如果代签行为构成无权代理且被代理人不追认，代签人可能需要承担赔偿责任。
- 如果代签行为构成表见代理，被代理人可能需要承担合同约定的义务和责任。
- 如果合同被认定为无效或可撤销，双方可能需要就合同无效或可撤销后的法律后果进行协商或诉讼，并可能承担相应的法律责任。
总结与进一步思考：
工程合同让别人代签且最后不承认是一个复杂的法律问题，涉及无权代理、表见代理以及合同效力等多个方面。在处理此类问题时，应充分考虑各方的权益和过错程度，并依据相关法律法规和司法解释进行判断和决策。如果您面临此类问题或有任何疑问，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。