结论：当公司签订的劳动合同中约定的工资与实际发放的工资不一致时，对劳动者的影响取决于差异的具体原因和性质。以下是对此问题的全面分析与处理建议：
一、差异原因及性质分析
合理差异：
- 绩效工资、奖金、津贴补贴等合理劳动报酬组成部分的差异，通常符合公司薪酬制度和法律法规，不构成问题。例如，合同中约定了基本工资，但实际发放时根据工作表现或公司业绩发放了额外的奖金或津贴，这种差异是合理的。
非法差异：
- 如果差异是由于用人单位故意压低合同工资以规避社保、税收等义务，或者无故克扣工资，则属于违法行为。例如，公司为了减少社保缴纳基数，故意在合同中约定较低的工资，而实际发放时却按较高标准发放，但又不将这部分工资纳入社保缴纳基数，这种行为就是违法的。
二、处理建议
实际工资高于合同约定工资：
- 一般情况下，这对劳动者是有利的，无需特别处理。但为了规范起见，建议劳动者与用人单位沟通，询问差异原因，并留下相关沟通记录作为证据。
- 双方可考虑签订补充协议，明确实际工资数额，以避免后续纠纷。
实际工资低于合同约定工资：
- 与公司协商：首先尝试与人力资源部门或上级领导友好沟通，指出工资差额并要求补足。
- 收集证据：收集劳动合同、工资条、银行工资流水明细、聊天记录等证据，以备后续维权使用。这些证据将有助于证明你的实际工资与合同约定工资存在差异。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，要求用人单位改正并补足工资差额。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查和处理。
- 申请劳动仲裁：如投诉未能解决问题，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求支付工资差额及相应经济补偿。劳动仲裁是解决劳动纠纷的一种有效方式，其裁决具有法律效力。
- 提起诉讼：对仲裁结果不满时，可在规定时间内向人民法院提起诉讼，通过司法途径解决争议。诉讼是解决劳动纠纷的最终手段，但过程可能相对较长且复杂。
三、特殊情况处理
- 未签订劳动合同：若用人单位未与劳动者签订劳动合同，且超过一个月不满一年，根据《劳动合同法》的规定，用人单位应每月支付二倍工资；满一年未签的，视为已订立无固定期限劳动合同，用人单位需承担相应法律责任。这种情况下，劳动者可以要求用人单位支付未签订劳动合同期间的双倍工资差额。
四、注意事项
- 时效问题：劳动者务必在法律规定的时效内主张权利，以免错过维权机会。例如，申请劳动仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
- 保留证据：在整个过程中，劳动者应妥善保管所有相关证据，以便在需要时提供证明。证据是维权的关键，没有证据将难以证明你的主张。
五、法律背景与后果
- 根据《劳动合同法》的规定，用人单位与劳动者订立的劳动合同应当明确约定工资等劳动报酬事项。如果用人单位未按照劳动合同约定支付劳动报酬，劳动者有权要求用人单位支付差额部分，并可能获得相应的经济补偿。
- 如果用人单位的违法行为情节严重，还可能面临劳动监察部门的行政处罚，甚至被追究刑事责任。
综上所述，当公司合同工资与实际工资不一致时，劳动者应首先明确差异原因及性质，然后根据具体情况选择合适的处理方式。在处理过程中，劳动者应注重证据的收集和保留，并在法律规定的时效内积极维护自身合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。