结论前置：签订的合同款支付金额与实际支付金额不一致，可能涉及合同变更、违约行为、计算错误或误解等多种情形，违反了《中华人民共和国民法典》中关于合同履行、价款确定及违约责任的相关规定。

一、可能违反的规定

1. 《中华人民共和国民法典》第五百一十条：

   • 合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
   • 分析：若合同中对价款有明确约定，但实际支付与约定不符，且双方未达成补充协议，则可能违反此条款，需按照合同相关条款或交易习惯确定实际支付金额。

2. 《中华人民共和国民法典》第五百一十一条：

   • 当事人就有关合同内容约定不明确，依据前条规定仍不能确定的，适用下列规定：…（二）价款或者报酬不明确的，按照订立合同时履行地的市场价格履行；依法应当执行政府定价或者政府指导价的，依照规定履行。
   • 分析：若因合同内容约定不明确导致实际支付金额与约定不符，且无法依据前条规定确定，则可能需按照市场价格或政府定价/指导价履行，这也可能构成对原合同约定的违反。

3. 《中华人民共和国民法典》中关于违约责任的规定：

   • 如第五百七十七条：当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
   • 分析：若一方未按合同约定支付金额，构成违约，需承担违约责任，包括支付剩余款项、赔偿损失等。

二、不一致的常见原因及法律后果

1. 合同变更：

   • 原因：双方在合同履行过程中，经协商一致对合同金额进行了调整，但未及时更新书面合同。
   • 法律后果：若能证明变更事实，则以变更后的金额为准；若无法证明，则可能构成违约，需承担违约责任。

2. 违约行为：

   • 原因：一方未按照合同约定的金额履行付款义务，如少付、逾期支付等。
   • 法律后果：守约方有权追究违约方的违约责任，要求支付剩余款项及相应利息等损失。合同中有明确违约责任条款的，按条款执行；无约定的，可要求赔偿因违约造成的损失。

3. 计算错误或误解：

   • 原因：合同签订时对价格计算方式、计价单位等存在错误理解，或付款时计算失误。
   • 法律后果：双方应积极沟通，核对账目，重新核算金额。能达成一致意见的，签订补充协议修正金额；无法协商解决的，可通过专业审计机构进行审计确定正确金额。提起诉讼时，主张方需提供充分证据证明错误或误解的存在。

4. 市场变化：

   • 原因：对于涉及价格波动的合同，如买卖合同，市场价格的变动可能导致实际支付金额与约定金额不一致。
   • 法律后果：若合同中有关于价格调整的约定，应按照约定执行；若无约定，则可能需要根据公平原则和市场行情进行合理调整。

三、处理建议

1. 协商解决：

   • 首选方法是双方友好协商，重新确认合同金额或签订补充协议，以明确双方的权利和义务。
   • 协商过程中应保留好沟通记录，以备后续可能的争议解决。

2. 依据合同条款或交易习惯确定：

   • 如果合同中有关于价款调整的相关条款，应按照条款执行。
   • 如无相关条款，可参照双方以往的交易习惯或行业惯例来确定实际支付金额。

3. 法律途径：

   • 若协商无果，且无法依据合同条款或交易习惯确定实际支付金额，受损方可通过诉讼或仲裁等法律手段来维护自身权益。
   • 在此过程中，需准备充分的证据材料，如合同文本、支付凭证、沟通记录等，以支持自己的主张。

总结：签订的合同款支付金额与实际支付金额不一致，可能涉及多种法律情形和后果。建议双方首先通过友好协商解决争议，并明确具体原因。若协商无果，可根据合同约定或法律规定申请仲裁或提起诉讼。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。