关于病假时间长取消年假是否按自然月计算的问题，结论是：病假时间长取消年假的计算方式并非严格按自然月进行，而是依据具体的累计病假天数以及职工的工作年限来确定。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，职工有下列情形之一的，不享受当年的年休假：

1. 职工依法享受寒暑假，其休假天数多于年休假天数的；
2. 职工请事假累计20天以上且单位按照规定不扣工资的；
3. 累计工作满1年不满10年的职工，请病假累计2个月以上的；累计工作满10年不满20年的职工，请病假累计3个月以上的；累计工作满20年以上的职工，请病假累计4个月以上的。

二、计算方式分析

1. 非自然月计算：从上述规定可以看出，取消年假的依据是累计病假天数，而非自然月。也就是说，即使病假跨越了自然月，但只要累计天数未达到规定标准，职工仍然有权享受年假。

2. 工作年限影响：取消年假的累计病假天数标准还与职工的工作年限有关。工作年限越长，允许的累计病假天数也越多，这体现了对老职工的照顾和尊重。

三、实际操作建议

1. 准确记录病假天数：企业和职工都应准确记录病假天数，以便在需要时进行核对和计算。

2. 及时沟通协商：如果职工因病假可能影响到年假的享受，建议及时与单位进行沟通协商，了解具体情况并寻求解决方案。

3. 遵守法律法规：企业和职工都应遵守相关法律法规，确保年假制度的公平、合理实施。

四、特殊情况说明

如果职工在病假期间恰好遇到单位安排的年假，且病假天数已经达到或超过取消年假的标准，那么职工将无法享受该年度的年假。但需要注意的是，这种情况下的年假取消并非因为自然月的划分，而是因为累计病假天数的达到。

总结来说，病假时间长取消年假并非按自然月计算，而是依据具体的累计病假天数以及职工的工作年限来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。