违规经营投资责任追究一般由企业的内部审计部门、纪检监察部门或专门的责任追究机构负责，具体取决于企业的内部架构和管理体系。以下从多个角度详细分析这一问题：

一、内部审计部门

内部审计部门在企业中扮演着重要的监督角色，它们负责定期对企业的经营活动进行审计，检查是否存在违规行为。当发现违规经营投资行为时，内部审计部门会进行初步调查，收集相关证据，并根据企业规定提出责任追究的建议。内部审计部门的工作重点在于发现和报告问题，为后续的责任追究提供依据。

二、纪检监察部门

纪检监察部门是企业中负责党风廉政建设和反腐败工作的专门机构。在违规经营投资责任追究方面，纪检监察部门会依据党纪国法和企业规定，对涉嫌违规的人员进行调查和处理。它们有权对违规行为进行立案审查，收集证据，提出处理意见，并监督处理决定的执行。纪检监察部门的工作具有更强的权威性和严肃性，能够确保责任追究的公正性和有效性。

三、专门的责任追究机构

一些大型企业或国有企业可能会设立专门的责任追究机构，如责任追究委员会或责任追究办公室等。这些机构通常由企业高层领导或相关部门负责人组成，负责全面协调和处理违规经营投资责任追究工作。它们有权对违规行为进行独立调查，提出处理建议，并监督处理决定的执行。专门的责任追究机构能够集中力量处理复杂的违规问题，确保责任追究的及时性和有效性。

四、企业主体责任与举报机制

无论由哪个部门负责违规经营投资责任追究，企业都应承担起主体责任，建立健全相关制度，明确责任追究的范围、程序和标准。同时，企业应鼓励员工积极举报违规行为，保护举报人的合法权益，并对举报有功人员进行奖励。这有助于形成企业内部良好的监督氛围，及时发现和纠正违规行为。

五、实际操作中的考虑因素

在实际操作中，企业可能会根据违规行为的性质、严重程度以及涉及人员的层级等因素，决定由哪个部门或机构负责责任追究。例如，对于轻微的违规行为，可能由内部审计部门进行处理；对于严重的违规行为或涉及高层管理人员的违规行为，则可能由纪检监察部门或专门的责任追究机构进行调查和处理。

建议：

• 企业应明确各部门在违规经营投资责任追究中的职责和权限，确保责任追究工作的顺利进行。
• 企业应加强对员工的培训和教育，提高员工的法律意识和合规意识，减少违规行为的发生。
• 如果您发现企业存在违规经营投资行为或需要了解更多关于责任追究的信息，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。