违规经营投资责任追究办法在国有企业中主要由企业的内部审计部门、纪检监察部门以及负责合规管理的专门部门（如有）共同负责实施与监督，但具体责任部门可能因企业架构和内部管理规定而有所不同。以下是对此问题的详细分析：
一、政策背景与目的
国务院国有资产监督管理委员会为强化国有资产监管，防止国有资产流失，并促进国有企业健康发展，出台了《中央企业违规经营投资责任追究实施办法（试行）》。该办法明确了违规经营投资的责任追究机制，旨在通过规范企业的经营投资行为，确保国有资产的保值增值。各地方国资委也结合实际情况制定了相应的地方性法规，以加强和规范地方国有企业的责任追究工作。
二、责任追究的主体部门
在国有企业中，违规经营投资责任追究工作通常涉及多个部门，主要包括：
内部审计部门：负责对企业经营投资活动进行内部审计监督，发现违规行为并及时报告。内部审计部门在责任追究过程中起着重要的监督作用，能够确保责任追究的公正性和准确性。
纪检监察部门：负责对企业内部的违纪违法行为进行查处，包括违规经营投资行为。纪检监察部门在责任追究中扮演着重要的角色，能够对违规行为进行严肃处理，维护企业的纪律和规矩。
合规管理部门（如有）：一些国有企业设立了专门的合规管理部门，负责企业的合规管理工作，包括制定合规政策、监督合规执行情况等。在违规经营投资责任追究中，合规管理部门可以提供专业的合规意见和支持，确保责任追究的合规性和有效性。
三、责任追究的具体实施
在具体实施责任追究时，国有企业通常会根据违规行为的性质、情节和后果等因素，对相关责任人进行不同程度的责任追究。这包括但不限于组织处理、经济处罚、禁入限制、纪律处分以及移送司法机关处理等措施。这些措施的实施旨在确保责任追究的严肃性和有效性，从而起到警示和震慑作用。
四、企业的主体责任与举报机制
国有企业应承担起违规经营投资责任追究的主体责任，建立健全相关制度，明确责任追究的范围、程序和标准。同时，企业应加强对制度执行情况的监督检查，确保责任追究工作的顺利进行。此外，企业还应鼓励内部员工积极举报违规行为，保护举报人的合法权益，并对举报有功人员进行奖励，以形成良好的内部监督氛围。
五、实际案例与操作建议
在实际操作中，国有企业可以根据自身情况制定具体的责任追究实施细则，明确各部门在责任追究中的职责和分工。例如，可以设立专门的责任追究委员会或工作小组，负责统筹协调责任追究工作；可以建立责任追究档案管理制度，对责任追究情况进行记录和跟踪；可以加强与外部监管机构的沟通和协作，共同打击违规经营投资行为。
总结来说，违规经营投资责任追究办法在国有企业中是一个涉及多个部门、需要多方协作的复杂工作。企业应根据自身情况建立健全相关制度，明确各部门职责和分工，确保责任追究工作的顺利进行。如果您在国有企业中遇到违规经营投资责任追究方面的问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。