关于病假工资第二阶段的计算，这通常涉及到连续休假超过6个月的情况，此时支付的是疾病救济费而非完整的病假工资。下面我将为您详细解释这一阶段的计算方法：

一、确定计算基数

1. 劳动合同有约定：首先，我们查看劳动合同中是否有关于病假工资基数的约定。如果有，且该约定不低于劳动者本人所在岗位（职位）相对应的工资标准，那么我们就按照这个约定来确定计算基数。如果集体合同（工资集体协议）确定的标准高于劳动合同约定，则按集体合同标准执行。

2. 无明确约定：如果劳动合同中没有明确约定病假工资基数，或者集体合同也未对此进行约定，那么我们可以由用人单位与职工代表通过工资集体协商来确定，并签订工资集体协议。

3. 无任何约定且未协商：在既无劳动合同约定，也无集体合同约定，且未进行工资集体协商的情况下，假期工资的计算基数统一按劳动者本人所在岗位（职位）正常出勤的月工资的70%确定。但需要注意的是，这个基数不得低于当地规定的最低工资标准。

二、确定疾病救济费系数

在连续休假超过6个月的情况下，我们支付的是疾病救济费，其系数与职工的连续工龄密切相关：

• 连续工龄不满1年的，系数为40%；
• 连续工龄满1年不满3年的，系数为50%；
• 连续工龄满3年及以上的，系数为60%。

三、计算疾病救济费

疾病救济费的计算公式为：疾病救济费 = 计算基数 × 疾病救济费系数。但需要注意的是，由于病假期间通常不会满整个月，因此在实际计算时，我们可能需要根据病假天数来按比例计算。不过，在连续休假超过6个月的长期病假情况下，我们通常按月来计算疾病救济费。

四、法律限制与最低工资保障

• 无论计算出的疾病救济费是多少，其金额均不得低于当地最低工资标准的80%，以确保职工的基本生活保障。
• 同时，疾病救济费也不得高于本人原工资水平及当地上年度职工月平均工资的相应比例（具体比例可能因地区而异）。

五、示例分析

假设某员工月工资为5000元，当地最低工资标准为2000元，该员工连续工龄为4年，因病连续请假超过6个月。

• 确定计算基数：因劳动合同未约定，故以本人正常出勤月工资的70%确定，即3500元（5000×70%），高于当地最低工资标准。
• 确定疾病救济费系数：根据连续工龄为4年（超过3年），系数为60%。
• 计算疾病救济费：疾病救济费 = 3500×60% = 2100元。由于2100元高于当地最低工资标准的80%（即1600元），因此该员工每月应领取的疾病救济费为2100元。

综上所述，病假工资第二阶段的计算（即连续休假超过6个月的情况）主要涉及到计算基数的确定、疾病救济费系数的确定以及法律限制与最低工资保障等方面。在实际操作中，我们需要根据当地的法律法规和政策文件来具体计算。如有任何疑问或争议，建议咨询专业的法律人士或当地劳动保障部门以获取准确的解答和处理。