针对您提出的“刑事案件羁押超一年怎么处理”的问题，我将结合相关法律法规和实际情况，为您详细解答。
首先，我们需要明确的是，羁押期限的合法性判断是处理此类问题的关键。在刑事案件中，羁押期限可能会因案件的性质、复杂程度以及侦查工作的需要而有所延长。但这种延长必须在法律规定的框架内进行，且需要经过相应的审批程序。
一、判断羁押的合法性
合法羁押：如果案件确实重大复杂，且经过多次依法延长羁押期限，仍在法定范围内，那么这种羁押就是合法的。在这种情况下，案件将继续按照法律程序进行处理，当事人需要耐心等待案件的最终结果。
超期羁押：如果羁押期限超过了法律规定的上限，或者未经合法程序延长，那么就可能构成超期羁押。超期羁押是违法的，侵犯了当事人的合法权益。
二、处理超期羁押的措施
申诉、控告：如果当事人或其法定代理人、近亲属、辩护人认为存在超期羁押的情况，有权向办案机关提出申诉或控告，要求解除羁押措施。办案机关在收到申诉或控告后，应当及时进行审查，并作出相应的处理决定。
申请变更强制措施：在申诉或控告的同时，当事人或其法定代理人、近亲属、辩护人还可以申请将羁押措施变更为取保候审或监视居住等更为轻缓的强制措施。这有助于保障当事人的合法权益，同时也有利于案件的进一步侦查和审理。
申请国家赔偿：如果超期羁押给当事人造成了损害，如人身自由受侵害、精神损害等，当事人有权依法申请国家赔偿。赔偿义务机关在收到赔偿申请后，应当在两个月内给予赔偿。如果赔偿义务机关未在规定期限内给予赔偿，或者当事人对赔偿数额有异议，还可以依法向人民法院提起诉讼。
三、实际案例分析
以您提供的案例为例，如果小朱被羁押一年多后，其家人认为已超期羁押并要求解除羁押措施，但办案机关称案件重大复杂且经过多次延长羁押期限仍在法定范围内，那么双方就需要通过法律途径来解决争议。在这种情况下，小朱的家人可以聘请律师进行法律咨询和代理，通过法律程序来维护小朱的合法权益。
综上所述，对于刑事案件羁押超一年的问题，我们需要首先判断羁押的合法性，然后根据不同情况采取相应的处理措施。如果您或您的亲友遇到了类似的问题，建议及时咨询专业律师并依法维护自己的合法权益。