在住院治疗费用由公司先行支付，后续涉及保险公司赔偿的情况下，赔偿款的支付对象需根据具体情况判断，以下是详细分析：

1. 若公司垫付费用时与患者有明确约定
   若公司垫付医疗费时，与患者签订了书面或口头协议，明确约定保险公司赔偿款归公司所有（例如：公司要求患者授权其直接领取赔偿款，或约定赔偿款优先抵扣公司垫付费用），则保险公司通常会将赔偿款支付给公司。
   法律依据：根据《民法典》第509条，当事人应按约定全面履行义务。若协议合法有效，保险公司需按约定支付。

2. 若未明确约定，需区分费用性质

   • 医疗费部分：若保险公司理赔范围包含医疗费，且患者未实际支付该费用（由公司垫付），则赔偿款原则上应支付给公司。因为患者未因医疗费产生实际损失，公司作为实际支出方有权主张权利。
     
   • 其他费用（如误工费、护理费等）：若赔偿包含患者因伤导致的其他损失（如误工费），这部分费用应支付给患者，因其是实际权利人。
     法律依据：根据《保险法》第65条，责任保险的被保险人给第三者造成损害，保险人可直接向第三者赔偿；但若被保险人已先行赔偿，则保险人应向被保险人支付。

3. 实务操作建议

   • 保留证据：公司需保存垫付费用的凭证（如转账记录、发票等），患者需保留医疗记录、诊断证明等，以证明费用实际发生。
     
   • 协商或诉讼：若双方对赔偿款归属有争议，可协商解决；协商不成，可通过诉讼明确权利归属，法院会综合费用垫付情况、保险合同约定等因素判决。
     提示：若公司垫付费用时未明确约定，患者可主张部分赔偿款（如非医疗费部分）；公司则可主张医疗费部分的赔偿款。

总结：赔偿款支付对象需以约定和费用性质为准。若有明确约定，按约定执行；若无约定，医疗费部分通常归公司，其他费用归患者。建议双方提前沟通并签订协议，避免后续纠纷。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。