如果您的农用三轮车被交警扣留了，您可以按照以下步骤来处理这个问题：
一、了解扣留原因
首先，您需要明确车辆被扣留的具体原因。这通常是因为车辆可能存在违反交通法规的情况，如无证驾驶、车辆未年检、超载、违规行驶等。了解扣留原因是解决问题的第一步，它有助于您后续采取正确的应对措施。
二、准备相关证件和资料
根据扣留原因，您需要准备相应的证件和资料。例如，如果是因为无证驾驶，您需要准备驾驶证；如果是因为车辆未年检，您需要准备车辆年检合格证明等。确保这些证件和资料齐全且有效，以便在后续处理中能够顺利通过审核。
三、前往交警部门接受处理
在准备好相关证件和资料后，您需要前往扣留车辆的交警部门接受处理。在处理过程中，您需要如实陈述情况，配合交警的调查和询问。交警会根据您的违法情况和相关法律法规，对您进行相应的处罚，如罚款、扣分等。
四、缴纳罚款并取回车辆
如果您接受了交警的处罚决定，并缴纳了相应的罚款，那么您就可以按照交警的指示，前往指定地点取回被扣留的车辆。在取回车辆时，请确保车辆完好无损，并检查车辆是否能够正常行驶。
五、注意事项
及时处理：请务必在交警部门规定的期限内前往接受处理，否则可能会面临更严重的处罚，甚至车辆被依法上缴国库。
遵守交通法规：为了避免类似情况再次发生，建议您严格遵守交通法规，确保车辆合法上路，文明驾驶。
了解相关法律法规：作为车主，您应该了解并熟悉相关的交通法律法规，以便在遇到问题时能够正确应对。
希望以上解答能够帮助您解决问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询交警部门或相关法律专业人士。