结论：合同一式四份，双方各执两份的情况下，并非所有两份都需要归档，归档的需求主要取决于合同双方的具体需求、内部管理规定以及可能的法律、监管要求。以下从不同角度进行详细分析：
合同双方的具体需求：
- 如果合同双方认为有必要保留所有合同副本以备不时之需，比如未来可能出现的争议解决、审计或合规检查等，那么双方可以选择将各自持有的两份合同都进行归档。
- 如果合同双方基于成本、存储空间或管理效率的考虑，认为只需要保留一份合同副本即可满足需求，那么双方可以协商确定只归档一份，而另一份作为备用或日常查阅使用。
内部管理规定：
- 许多企业或组织都有内部的管理规定或流程，要求对于重要合同必须进行归档保存。在这种情况下，合同双方应遵循各自的内部管理规定，决定归档的合同副本数量。
- 如果一方或双方有严格的档案管理要求，比如需要按照时间、类型或重要性对合同进行分类归档，那么双方应协商确定如何满足这些要求，包括归档的合同副本数量。
法律、监管要求：
- 在某些行业或领域，法律或监管机构可能对合同的归档有具体要求。例如，金融行业可能要求保留一定期限内的所有交易合同以备监管检查。
- 如果合同涉及跨境交易或国际业务，还可能受到不同国家或地区法律、监管要求的影响。在这种情况下，合同双方应咨询专业法律人士，了解并遵守相关法律、监管要求，决定归档的合同副本数量。
建议：
- 在签订合同时，合同双方可以明确约定归档的合同副本数量以及归档的方式、期限等事项，以避免未来可能出现的争议。
- 如果合同双方对归档要求存在分歧或不确定如何处理，可以寻求专业法律人士的帮助，以确保合同的归档符合法律、监管要求以及双方的利益。
可能的法律后果：
- 如果合同双方未按照法律、监管要求或内部管理规定进行合同归档，可能会面临法律处罚、监管制裁或内部纪律处分等后果。
- 在争议解决过程中，如果合同双方无法提供完整的合同副本作为证据，可能会影响争议的解决结果，甚至承担不利的法律后果。
因此，合同一式四份双方各执两份时，是否需要归档两份取决于多种因素。合同双方应根据自身需求、内部管理规定以及法律、监管要求来综合决定。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。