车辆挂靠协议中的免责条款在一定条件下是有效的，但其有效性并非绝对，需根据具体情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
免责条款有效的条件
协议内容合法且真实有效：
- 车辆挂靠协议中的免责条款必须是双方自愿签订，内容不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，且不存在欺诈、胁迫等导致合同无效或可撤销的情形。
- 免责条款应明确约定免责的范围和条件，例如，在特定情形下（如挂靠车辆因不可抗力或第三方原因造成的损失）挂靠方不承担赔偿责任。
双方真实意愿的体现：
- 免责条款必须是双方真实意思的表示，任何一方不得利用优势地位或对方缺乏经验等情形，迫使对方接受不公平的免责条款。
出借方/挂靠方无过错：
- 在车辆挂靠关系中，如果出借方（即车辆所有者）或挂靠方在协议履行过程中无过错，且已尽到合理的注意义务，那么免责条款在特定情况下可能有效。例如，如果挂靠车辆因借用人的无证驾驶或酒后驾驶等违法行为导致事故，且出借方/挂靠方对此并不知情，那么免责条款可能保护出借方/挂靠方免受法律追究。
免责条款可能无效的情形
违反法律规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，造成对方人身损害的免责条款无效。因此，如果车辆挂靠协议中的免责条款试图免除因故意或重大过失造成的人身损害赔偿责任，那么这些条款将被视为无效。
- 如果免责条款违反了法律法规的强制性规定，如以挂靠形式从事道路运输经营活动但缺乏相应资质，或者存在恶意串通损害国家、集体或第三人利益的情形，那么这些条款也将被判定为无效。
出借方/挂靠方存在过错：
- 如果出借方/挂靠方在协议履行过程中存在过错，如明知挂靠车辆存在安全隐患仍允许其上路运营，或者明知借用人无驾驶资格仍借出车辆，那么免责条款将无法保护出借方/挂靠方免受法律追究。
协议形式不合法或未明确告知：
- 免责条款必须以书面形式明确约定，并有双方的签字或盖章确认。如果协议形式不合法，如口头约定或未签字确认，则免责条款可能无效。
- 根据相关法律规定，如果免责条款是格式条款（即预先拟定、未经协商的条款），且出借方/挂靠方在订立合同时未向对方进行提示或说明，那么该条款可能无效。
综合判断与建议
在实际操作中，对于车辆挂靠协议中免责条款的效力认定需综合考量多方面因素，包括事故发生的具体原因、双方的行为表现以及合同签订的具体细节等。为确保双方权益，建议在签订车辆挂靠协议时：
- 明确约定免责条款：双方应充分协商并明确约定免责的范围和条件，确保条款内容合法、真实、有效。
- 确保协议形式合法：免责条款必须以书面形式明确约定，并有双方的签字或盖章确认。
- 充分了解法律规定：双方应充分了解相关法律法规的规定，确保协议内容不违反法律法规的强制性规定。
- 咨询专业律师：在签订协议前，如有需要，可向我咨询以获取更具体的法律建议，确保协议的合法性和有效性。
综上所述，车辆挂靠协议中的免责条款的有效性需根据具体情况进行综合判断。在签订协议时，双方应谨慎行事，确保协议的合法性与有效性，以避免不必要的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。