结论：老板扣工资两千是否合理，需分情况讨论。若您与老板之间未签订书面劳动合同，但已形成事实劳动关系，老板无合法理由扣工资两千是不合理的；若您存在违反公司规章制度、给公司造成损失等情形，老板扣工资需在合理范围内，且两千的扣除额度是否合理需结合具体情况判断。
一、未签订书面劳动合同，但形成事实劳动关系的情况
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。虽然您与老板未签订书面劳动合同，但只要您实际为老板提供了劳动，双方就形成了事实劳动关系。
在事实劳动关系下，老板应当按照约定和国家规定，向您及时足额支付劳动报酬。如果老板无正当理由扣您工资两千，这显然违反了法律规定，是不合理的。您有权要求老板补发被扣的工资，并可以通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。
二、您存在违反公司规章制度、给公司造成损失等情形的情况
如果您在工作中存在违反公司规章制度、给公司造成损失等情形，老板有权根据公司的规章制度和劳动合同的约定，对您进行一定的经济处罚。但是，这种处罚必须在合理范围内，且不能违反法律法规的强制性规定。
关于处罚的合理性：
- 老板扣工资的额度应当与您的过错程度、给公司造成的损失大小等因素相适应。如果老板扣您工资两千，但您给公司造成的损失远小于这个数额，或者您的过错程度并不严重，那么这种扣除额度就可能被认为是不合理的。
关于法律法规的强制性规定：
- 根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位不得克扣劳动者工资，除非有法定情形（如代扣代缴个人所得税、社会保险费等）或双方约定（如违反公司规章制度的经济处罚等）。即使存在约定，扣除的部分也不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
- 计算公式：若当月工资为W，则最多可扣除金额=W×20%，且扣除后剩余工资≥当地最低工资标准。例如，若您当月工资为5000元，则最多可扣除1000元（5000×20%），扣除后剩余工资至少为4000元（需确保不低于当地最低工资标准）。若老板扣您两千，显然超过了这一比例限制（除非您当月工资远高于5000元，且扣除后仍不低于最低工资标准），因此是不合理的。
三、建议与行动
与老板沟通：
- 首先，您可以尝试与老板进行沟通，了解扣工资的具体原因和依据。如果老板无法提供合理的解释和依据，您可以明确表示反对，并要求补发被扣的工资。
收集证据：
- 如果沟通无果，您可以开始收集相关证据，如工作记录、工资条、与老板的沟通记录等，以证明您与老板之间存在事实劳动关系，以及老板扣工资的不合理性。
申请劳动仲裁：
- 如果证据充分，您可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求老板补发被扣的工资，并可能要求支付经济补偿金等。
寻求法律援助：
- 如果您在劳动仲裁过程中遇到困难或需要进一步的法律帮助，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和支持。
总之，老板扣工资两千是否合理，需结合您的具体情况和法律法规的强制性规定来判断。如果您认为老板的行为不合理，可以通过沟通、收集证据、申请劳动仲裁等途径维护自己的合法权益。