行政协议已履行完毕，在特定情况下仍然可以再起诉。以下是对这一问题的详细分析：

1. 行政协议的可诉性基础：

   • 行政协议，作为行政机关与公民、法人或其他组织之间设立、变更、终止行政法律关系的协议，具有可诉性。这意味着，当行政协议的履行过程中或履行完毕后，若存在争议或违法行为，相关方有权通过法律途径寻求解决。

2. 履行完毕后的起诉情形：

   • 协议存在违法情形：如果行政协议在签订或履行过程中存在违法行为，如行政机关超越职权、违反法定程序等，即使协议已经履行完毕，相关方仍可以提起行政诉讼，请求法院确认协议无效或撤销协议，并可能要求行政机关承担相应的法律责任。
   • 协议履行存在瑕疵：若行政协议在履行过程中存在瑕疵，如未完全履行、履行不符合约定等，且这种瑕疵对相关方的权益造成了实质性影响，那么相关方在协议履行完毕后仍然可以提起诉讼，要求行政机关承担违约责任或进行补救。
   • 后续发现新证据或事实：在行政协议履行完毕后，如果相关方后续发现了新的证据或事实，能够证明行政机关在协议签订或履行过程中存在违法行为或不当行为，且这种行为对相关方的权益造成了损害，那么相关方也可以提起诉讼。

3. 起诉的注意事项：

   • 起诉期限：虽然行政协议已履行完毕，但相关方在提起诉讼时仍需注意起诉期限的问题。根据《中华人民共和国行政诉讼法》的规定，提起行政诉讼应当在知道或应当知道行政机关作出具体行政行为之日起一定期限内提出。因此，相关方应及时行使诉讼权利，避免超过起诉期限而丧失胜诉权。
   • 证据收集：在提起诉讼前，相关方应充分收集证据，以证明行政机关在协议签订或履行过程中存在违法行为或不当行为，以及这种行为对自身权益造成的损害。证据的充分性和确凿性对于诉讼的成败至关重要。

4. 法律后果与救济：

   • 如果法院经审理认为行政协议存在违法情形或履行瑕疵，且相关方的诉讼请求成立，那么法院可能会判决确认协议无效、撤销协议、要求行政机关承担违约责任或进行补救等。这些判决结果将有助于维护相关方的合法权益，并促进行政机关依法行政。

建议：如果您认为行政协议在签订或履行过程中存在违法行为或不当行为，且这种行为对您的权益造成了损害，即使协议已经履行完毕，您仍然可以考虑提起行政诉讼。在提起诉讼前，建议您充分收集证据，并咨询专业律师（即我本人，王旭东律师，专注于刑事辩护、行政纠纷领域）的意见，以确保诉讼的有效性和成功率。