在合伙做生意对方拿钱跑了的情况下，起诉时利息的计算需分情况讨论，具体如下：

1. 若双方有书面约定利息
   根据《民法典》第六百七十六条，借款人未按约定期限返还借款的，应当按照约定或国家规定支付逾期利息。若合伙协议或借款凭证中明确约定了利息计算方式（如年利率%、复利规则等），法院会优先按约定判决，但需注意：

   • 约定利率不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的4倍，超出部分法院不予支持；
     
   • 若约定了“违约金+利息”，总计超过LPR4倍的部分同样无效。

2. 若双方未约定利息，但对方逾期未还款
   根据《民法典》第六百八十条及《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，可主张逾期利息：

   • 计算起点：从对方实际违约之日（如约定还款日次日）起算；
     
   • 计算标准：以违约时一年期LPR为基准，法院可能支持按此标准计算资金占用期间的损失。
     例如：若对方于2023年1月1日应还款但未还，2023年1月20日LPR为3.65%，则逾期利息可按年利率3.65%主张。

3. 若对方行为涉嫌刑事犯罪（如诈骗）
   若对方拿钱跑路的行为被认定为诈骗、职务侵占等刑事犯罪，利息计算可能让位于刑事追赃程序。此时：

   • 刑事判决可能责令退赔本金及直接损失（如已支付的利息），但一般不支持额外利息；
     
   • 民事诉讼中可主张的利息，需以刑事退赔不足部分为前提，且仍需符合前述利率限制。

行动建议：

1. 立即收集证据：合伙协议、转账记录、沟通记录（如微信、邮件）等，证明对方拿钱的事实及金额；
   
2. 明确诉求：根据证据情况，选择主张约定利息、逾期利息或刑事退赔+民事赔偿的组合方案；
   
3. 尽快起诉：避免超过3年诉讼时效（从知道权利受损之日起算），防止丧失胜诉权。
   

若需进一步分析证据或制定诉讼策略，可随时向我提供具体细节，我会结合案情为您细化方案。