结论：老师因学生上学拿手机而让学生回家两星期的行为，其合法性需根据具体情况来判断，一般情况下可能不合法，但若学校规章制度有明确规定且符合相关法律法规，则可能被视为合法。
分析：
从教育法律法规的角度：
- 根据我国的教育法律法规，学生享有接受教育的权利，学校应当保障学生的受教育权不受侵犯。老师因学生携带手机而让学生回家两星期，实际上剥夺了学生在这段时间内接受教育的权利，这种行为可能违反了教育法律法规中关于保障学生受教育权的规定。
从学校规章制度的角度：
- 如果学校有明确的规章制度，规定学生不得携带手机进入校园，或者对携带手机的学生有相应的处罚措施，且这些规章制度是经过合法程序制定并公示的，那么老师根据这些规章制度对学生进行处罚，可能被视为合法。但即便如此，处罚措施也应当合理、适度，不能过度剥夺学生的受教育权。
- 关键点：规章制度需合法制定、公示，且处罚措施需合理适度。若学校规章制度中未明确规定此类处罚，或处罚措施过于严厉（如长时间停课），则可能不合法。
从实际操作的合理性角度：
- 老师让学生回家两星期，这种处罚措施可能过于严厉，不利于学生的成长和教育。学校应当采取更加温和、有效的教育方式，如与学生沟通、家长配合、暂时保管手机等，来引导学生遵守学校规定，而不是简单地采取停课等严厉措施。
建议：
- 对于学生：如果遇到此类情况，可以首先与老师沟通，了解处罚的具体原因和依据。如果认为处罚不合理或侵犯了自己的合法权益，可以向学校领导或相关部门反映情况，寻求帮助。
- 对于家长：应当与学校保持密切联系，了解孩子在校的情况。如果发现学校或老师的处罚措施不合理或侵犯了孩子的合法权益，应当及时与学校沟通，必要时可以寻求法律援助。
- 对于学校：应当制定合理、适度的规章制度，并加强对老师的培训和管理，确保老师能够依法、依规对学生进行教育和管理。同时，学校也应当建立有效的沟通机制，及时与学生和家长沟通，解决可能出现的问题。
后续思考：
- 在处理此类问题时，需要平衡学校的纪律管理需求和学生的受教育权。学校应当采取既能够维护纪律又能够保障学生权益的措施。
- 如果学校或老师的处罚措施确实侵犯了学生的合法权益，学生或家长可以通过法律途径来维护自己的权益。如有具体法律问题，可以直接向我咨询。