关于私人公司病假如何扣工资的问题，这主要取决于劳动合同中的约定、公司内部规章制度以及国家相关法律法规的规定。以下是一个详细且深入的解答：
一、法律依据与基本原则
根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》及相关法律法规，员工在患病或非因工负伤治疗期间，公司应支付病假工资或疾病救济费。这一费用可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。这是保障员工基本生活需求的法律底线。
二、病假工资的计算方式
计算基数：
- 劳动合同约定：首先，应查看劳动合同中是否明确约定了病假工资的计算基数。如果合同中有约定，且该基数不低于当地最低工资标准，则按照合同约定执行。
- 集体合同规定：若劳动合同无约定或约定不明，且公司有集体合同的，则按照集体合同规定的病假工资计算基数执行。
- 国家规定：在既无劳动合同约定又无集体合同约定的情况下，公司可在不低于当地最低工资标准的80%范围内确定病假工资计算基数。通常，这一基数会按照员工正常出勤月工资的70%来确定，但同样不能低于当地最低工资标准。
计算系数：
- 病假工资的计算系数与员工在本公司的工作年限及病假时长密切相关。一般来说，连续工龄越长，病假工资的计算系数越高。具体来说，连续工龄不满2年的，按本人工资的60%计发；满2年不满4年的，按70%计发；满4年不满6年的，按80%计发；满6年不满8年的，按90%计发；满8年及以上的，则按100%计发，即不扣款。
具体计算：
- 最终病假工资 = 病假工资计算基数 ÷ 21.75（月计薪天数）× 病假天数 × 相应比例（根据工作年限和病假时长确定的系数）。
三、特殊情况与处理
长病假情况：
- 对于连续请较长时间病假（如超过6个月）的员工，公司应支付疾病救济费。具体标准根据连续工龄的不同而有所差异，但同样不得低于当地最低工资标准的80%。
高于法定标准：
- 公司可以自行制定高于法律规定标准的病假工资政策，以体现对员工的关怀和照顾。但这一标准不得低于法定标准。
地区性差异：
- 不同地区可能在具体规定和操作细节上存在差异。因此，公司和员工在处理病假工资问题时，应遵循当地的具体规定。
四、员工权益保障与争议解决
权益保障：
- 员工在遇到病假工资不合理扣除等情况时，应首先与公司沟通协商，寻求合理解决方案。
争议解决：
- 如果协商不成，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自身权益。劳动监察部门和劳动仲裁机构将依法对争议进行调查和处理，确保员工的合法权益得到保障。
五、实际建议
- 查看合同与制度：员工在入职时，应仔细阅读劳动合同和公司内部规章制度，了解病假工资的具体规定。
- 保留证据：在请病假时，员工应保留好相关医疗证明和请假记录等证据，以备不时之需。
- 及时沟通：如果员工对病假工资有疑问或不满，应及时与公司沟通协商，避免问题扩大化。
综上所述，私人公司在处理病假工资问题时，应严格遵守国家相关法律法规和合同约定，确保员工的合法权益得到保障。同时，员工也应了解自己的权益和义务，在必要时采取适当措施维护自身权益。