结论：员工签了三个月后离职的协议，但想提前离职是否合法，需分情况讨论。

1. 若劳动合同或协议中未明确约定提前离职的违约责任或限制：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者有权提前三十日以书面形式通知用人单位解除劳动合同（试用期内为三日）。这是法律赋予劳动者的基本权利，旨在保障劳动者的自由择业权。
   • 在此情况下，即使员工与用人单位约定了三个月后离职，但员工若希望提前离职，只需按照法律规定提前三十日（或试用期内提前三日）书面通知用人单位，即可合法解除劳动合同。

2. 若劳动合同或协议中明确约定了提前离职的违约责任或限制：

   • 如果劳动合同或协议中明确约定了员工提前离职需支付违约金、承担赔偿责任或受到其他限制，那么员工在提前离职时可能需要遵守这些约定。
   • 但需要注意的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者约定的违约金或赔偿责任必须合理，且不得违反法律、行政法规的强制性规定。如果约定过于苛刻或显失公平，员工有权提出异议，并可能通过法律途径维护自己的合法权益。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 如果员工因个人原因（如突发疾病、家庭变故等）需要立即离职，且无法按照法律规定提前通知用人单位，那么员工应尽可能与用人单位协商解决，以减少对用人单位的影响。
   • 在某些特殊行业或岗位（如涉及国家秘密、商业秘密等），用人单位可能对员工的离职有更为严格的规定。员工在提前离职时，应特别注意遵守这些规定，以避免法律纠纷。

法律建议：

• 员工在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于离职的约定。如有疑问或不满，应及时向用人单位提出并协商解决。
• 如果员工希望提前离职，应尽早与用人单位沟通，并按照法律规定提前通知用人单位。同时，应保留好书面通知的证据，以备不时之需。
• 如果员工与用人单位在离职问题上产生争议，可以寻求劳动争议调解委员会的帮助进行调解，或者依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

可能法律后果：

• 如果员工未按照法律规定或合同约定提前通知用人单位而擅自离职，可能会面临用人单位的索赔要求，包括但不限于因员工擅自离职给用人单位造成的直接经济损失、招聘替代人员的费用等。
• 如果员工与用人单位在离职问题上产生争议且无法协商解决，可能会引发劳动争议仲裁或诉讼程序，增加双方的时间和精力成本。

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