结论：员工拿公司扔掉的食物是否需要赔偿，需根据具体情况判断，主要涉及是否构成“侵占公司财物”或违反公司规章制度，以下分情况说明：
若食物已明确被公司丢弃（无争议）
若公司已通过丢弃、销毁等明确行为表示放弃食物所有权（如将食物倒入垃圾桶、张贴“废弃”标识等），此时食物属于无主物，员工捡拾通常不构成违法或违约，无需赔偿。但需注意：
- 若公司内部规章制度明确禁止员工捡拾废弃物（如出于卫生、安全考虑），员工可能因违反制度受到内部处分（如警告、扣绩效等），但一般不涉及民事赔偿；
- 若员工捡拾行为导致公司其他损失（如清理费用增加、影响正常运营等），公司可能要求员工承担部分责任，但需举证损失与员工行为的直接因果关系。
若食物未被公司明确丢弃（存在争议）
若食物仅被临时放置（如未清理的剩饭、待处理的过期食品），且公司未明确表示放弃所有权，员工擅自拿走可能被认定为“侵占公司财物”，需承担以下责任：
- 民事赔偿：公司可要求员工返还食物或按市场价赔偿；若食物具有特殊价值（如用于检测的样品、客户赠送的礼品等），可能需按实际损失赔偿；
- 内部处分：根据公司规章制度，员工可能面临警告、罚款、解除劳动合同等处分；
- 行政或刑事责任：若食物价值较高（如多次拿取或涉及贵重物品），可能触犯《治安管理处罚法》第49条（盗窃）或《刑法》第264条（盗窃罪），但实践中因食物价值较低，通常以民事或内部处理为主。
特殊情形：食物来源或用途影响定性
- 若食物属于客户赠送、员工福利或特定项目物资（如实验食材），即使未被“丢弃”，员工擅自拿走也可能被认定为侵占或违反职业道德；
- 若员工因生活困难临时拿取且无恶意，公司可能从人性化角度处理，但需员工主动沟通说明情况，避免误解。
建议：
- 对员工：若需拿取公司废弃物，建议先确认食物状态（如是否已丢弃、是否有禁止捡拾标识）或与公司沟通，避免纠纷；
- 对公司：若不希望员工捡拾废弃物，可通过规章制度明确禁止，并设置废弃物处理流程（如统一回收、销毁），减少争议。
如有具体案件细节（如食物价值、公司态度、员工行为动机等），可进一步向我咨询，我会结合证据分析责任。