结论：在合同纠纷中，若乙方负责人未能及时支付款项，第三方在一定条件下是可以代为支付的，但具体是否可行需结合合同条款、双方约定及法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、合同条款的约定

1. 合同中是否有明确约定：

   • 如果合同中明确规定了第三方代为支付的条件、方式及责任等，那么第三方在符合这些条件的情况下，是可以代为支付的。例如，合同中可能约定：“若乙方未能按时支付款项，甲方有权要求第三方（如乙方的关联公司或担保人）代为支付。”

2. 合同无明确约定时的处理：

   • 如果合同中没有明确约定第三方代为支付的相关条款，那么第三方代为支付的行为可能构成无因管理或债务承担，需要依据相关法律规定及双方的具体情况来判断其合法性及效力。

二、法律规定的适用

1. 无因管理：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无因管理是指没有法定的或者约定的义务，为避免他人利益受损失而进行管理的人，有权请求受益人偿还由此支出的必要费用。如果第三方代为支付是为了避免乙方的利益受损（如避免乙方因违约而承担更大的法律责任），且没有法定的或约定的义务，那么第三方可能构成无因管理，有权要求乙方偿还其代为支付的款项。

2. 债务承担：

   • 债务承担是指债务人将合同的义务全部或者部分转移给第三人的情况。如果第三方愿意承担乙方的付款义务，并且得到了甲方的同意，那么可以构成债务承担。在这种情况下，第三方将取代乙方成为新的债务人，负责向甲方支付款项。

三、实际操作中的注意事项

1. 第三方的支付意愿与能力：

   • 在考虑第三方代为支付时，首先要确认第三方是否有支付的意愿和能力。如果第三方不愿意或没有能力支付，那么这种代为支付的行为将无法实现。

2. 甲方的同意与接受：

   • 即使第三方愿意代为支付，也需要得到甲方的同意和接受。如果甲方不同意第三方代为支付，或者对第三方的支付能力、信誉等存在疑虑，那么这种代为支付的行为也可能无法得到实施。

3. 书面协议的签订：

   • 为了确保第三方代为支付的行为的合法性和有效性，建议双方（包括甲方、乙方和第三方）签订书面协议，明确各自的权利和义务、支付方式、支付时间等关键条款。

四、可能面临的法律后果

1. 如果第三方代为支付合法有效：

   • 那么乙方将不再承担该笔款项的支付义务，而是由第三方承担。同时，乙方可能需要向第三方偿还其代为支付的款项（如果构成无因管理）或确认债务承担的效力（如果构成债务承担）。

2. 如果第三方代为支付存在瑕疵或无效：

   • 那么乙方可能仍然需要承担该笔款项的支付义务，并可能因违约而承担相应的法律责任。同时，第三方也可能因不当支付而面临一定的法律风险。

建议：在实际操作中，如果涉及第三方代为支付的情况，建议双方（包括甲方、乙方和第三方）充分沟通、协商，并签订书面协议以明确各自的权利和义务。如有需要，可以向我咨询具体的法律条款和操作流程，以确保交易的合法性和有效性。