商业用地期限过期后，土地使用者确实会面临一系列处理选择，这些选择主要基于现行的法律法规，包括《中华人民共和国民法典》、《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》以及《中华人民共和国城市房地产管理法》等。以下是对商业用地期限过期后处理方式的详细解答：

一、申请续期

法律依据与操作流程：

• 根据《中华人民共和国民法典》第三百五十九条，非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，需依照法律规定办理。同时，《中华人民共和国城市房地产管理法》第二十二条也明确指出，土地使用权出让合同约定的使用年限届满，土地使用者需要继续使用土地的，应当至迟于届满前一年申请续期。
• 土地使用者应向土地管理部门（如国土资源管理局）提交续期申请书，并附上相关证明材料。土地管理部门会根据社会公共利益需要决定是否批准续期申请。
• 若获得批准，土地使用者需重新签订土地出让合同，支付土地使用权出让金，并办理登记手续。续期费用的缴纳或减免，将依照法律、行政法规的规定办理。

注意事项：

• 土地使用者应提前了解续期的具体条件和流程，确保在期限届满前一年内提交申请。
• 若因社会公共利益需要（如建设公共基础设施），政府可能不批准续期申请，此时土地使用者应关注后续补偿事宜。

二、国家收回土地与补偿

条件与法律依据：

• 若土地使用者未申请续期或申请续期但未获批准，根据《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》的相关规定，土地使用权将由国家无偿收回。
• 收回土地时，政府会对土地上的房屋及其他不动产进行评估，并给予相应补偿。补偿标准通常参照市场价值，考虑建筑物的结构、成新率、用途、土地位置等因素。

后续处理：

• 土地使用者应交还土地使用证，并依照规定办理注销登记。
• 对于地上建筑物及其他附着物，政府会依法收回，并确保补偿过程公平、公正，保障土地使用者的合法权益。

三、土地用途变更或重新规划

政府规划调整：

• 随着城市发展，政府可能会对商业用地进行重新规划，如将其调整为居住用地或公共服务设施用地等。

协商与补偿：

• 若政府决定对土地用途进行变更或重新规划，应与土地使用者进行协商，明确具体方案。
• 土地使用者应积极配合政府的规划调整，按要求进行土地移交或改造。同时，政府应给予土地使用者合理补偿，以确保其权益不受损害。

四、建议与总结

当商业用地即将到期时，我建议您：

• 提前准备：提前与相关部门沟通，了解续期的具体流程和条件，以及无法续期时的补偿政策。
• 积极申请：若有意续期，应及时提交续期申请，并准备相关材料，确保申请过程顺利。
• 关注补偿：若无法续期或选择不续期，应了解补偿政策，并与政府协商确定补偿方案，确保自身权益得到充分保障。
• 寻求法律帮助：在整个过程中，如需法律帮助或咨询，应寻求专业的律师或法律机构，以确保自身权益得到充分保护。

综上所述，商业用地期限过期后的处理方式多种多样，土地使用者应根据自身情况和法律法规要求，及时做出选择并办理相关手续。通过提前准备和积极沟通，您可以更有效地应对这一挑战。