结论：在建设工程合同中，若约定盖二层而实际盖三层，通常构成违约，但具体是否违约还需结合合同条款、双方约定及实际履行情况综合判断。以下从不同角度详细分析：

1. 合同条款的明确性：

   • 若合同明确约定层数：如果建设工程合同中明确约定了建筑物的层数为二层，那么承包方未经发包方同意，擅自加盖至三层，显然违反了合同约定，构成违约。
   • 若合同未明确约定层数：如果合同中并未明确约定建筑物的具体层数，或者约定较为模糊，那么是否构成违约就需要根据合同的其他条款、双方交易习惯以及行业惯例等因素来综合判断。

2. 双方约定的变更：

   • 书面变更：在合同履行过程中，如果双方通过书面形式对建筑物的层数进行了变更，并得到了双方的确认，那么这种变更就是有效的，不构成违约。
   • 口头变更：如果双方只是口头约定变更建筑物的层数，而没有形成书面协议，那么在发生纠纷时，这种口头变更的证明难度较大，且可能因缺乏证据支持而不被法院或仲裁机构认可。

3. 实际履行情况：

   • 加盖行为是否得到发包方认可：如果承包方在加盖过程中，得到了发包方的明确认可或默许，那么这种加盖行为可能不构成违约。但需要注意的是，发包方的认可或默许应当有明确的证据支持，如书面同意、现场签证等。
   • 加盖行为是否影响工程质量：如果加盖行为导致了工程质量问题，如结构安全、使用功能等受到影响，那么无论发包方是否认可，承包方都可能因违反合同约定的质量标准而构成违约。

4. 法律后果：

   • 违约责任：如果承包方的加盖行为构成违约，那么根据合同约定和法律规定，承包方可能需要承担违约责任，如赔偿损失、支付违约金等。
   • 合同解除：在严重违约的情况下，发包方还有权解除合同，并要求承包方承担因此造成的损失。

建议：

• 对于发包方而言，在签订建设工程合同时，应当明确约定建筑物的层数、质量标准等关键条款，并在合同履行过程中加强监督和管理，确保承包方按照合同约定进行施工。
• 对于承包方而言，应当严格遵守合同约定，未经发包方同意不得擅自变更施工内容。如果确实需要变更，应当及时与发包方协商并签订书面变更协议。

示例： 假设某建设工程合同中明确约定了建筑物的层数为二层，但承包方在未经发包方同意的情况下擅自加盖至三层。在这种情况下，承包方的行为显然违反了合同约定，构成违约。发包方有权要求承包方拆除加盖的部分，并承担因此造成的损失。如果双方无法协商解决，发包方还可以通过法律途径追究承包方的违约责任。

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