单位不能自主决定1万元以上招投标是否合法，这主要取决于相关法律法规的规定以及单位内部的管理制度，但通常来说，单位自行设定1万元以上必须招投标的标准并不直接具有法律效力，需结合具体情况判断。以下从几个角度进行详细分析：

一、法律法规的角度

1. 招投标法规定：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，对于必须进行招标的项目范围有明确的规定，如大型基础设施、公用事业等关系社会公共利益、公众安全的项目，以及全部或者部分使用国有资金投资或者国家融资的项目等。这些规定并未直接提及“1万元以上”作为招投标的标准。
   • 招投标法主要关注的是项目的性质、规模以及资金来源等因素，而非单位自行设定的金额标准。

2. 单位内部规定与法律冲突：

   • 如果单位内部规定“1万元以上必须招投标”，而这一规定与法律法规无直接冲突（即法律法规未明确禁止单位设定此类标准），但单位的规定不能违反法律法规的强制性规定和原则。
   • 实际上，单位自行设定的金额标准（如1万元）通常不具有直接的法律效力，除非该标准被纳入地方性法规、规章或行业规范中，且这些规范与上位法不冲突。

二、单位自主管理与合规性的角度

1. 单位自主管理权：

   • 单位在内部管理上有一定的自主权，可以设定一些规章制度来规范内部行为。然而，这种自主权必须在法律法规的框架内行使。
   • 单位自行设定招投标标准可能出于内部管理、成本控制等考虑，但必须确保这些标准不违反法律法规的强制性规定。

2. 合规性风险：

   • 如果单位自行设定的招投标标准过低（如1万元），且未遵循公开、公平、公正的原则，可能引发合规性风险，如被质疑存在利益输送、不公平竞争等问题。
   • 在极端情况下，如果单位的行为违反了招投标法等法律法规的强制性规定，还可能面临行政处罚或法律责任。

三、实际操作与建议

1. 遵循法律法规：

   • 单位在设定招投标标准时，应首先遵循相关法律法规的规定，确保标准的合法性和合规性。
   • 如果法律法规对招投标标准有明确规定，单位应严格执行这些规定。

2. 结合实际情况制定合理标准：

   • 在法律法规未明确规定的情况下，单位可以结合自身的实际情况（如项目规模、资金来源、风险控制等）制定合理的招投标标准。
   • 这些标准应既符合单位内部管理的需要，又避免引发合规性风险。

3. 咨询专业法律意见：

   • 在设定或调整招投标标准时，单位可以咨询专业律师的意见，以确保标准的合法性和合规性。
   • 律师可以根据单位的实际情况和法律法规的规定，提供具体的法律建议和指导。

总结来说，单位不能单纯自主决定1万元以上必须招投标是否合法，而应结合相关法律法规的规定以及单位内部的管理制度来综合判断。在设定招投标标准时，单位应遵循法律法规的强制性规定，结合实际情况制定合理标准，并咨询专业法律意见以确保合规性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。