关于资质处罚的主体问题，这通常取决于具体的违规行为和相关的法律法规。在大多数情况下，资质处罚的主体并不一定是发证机关，而是根据违规行为的性质和严重程度，由相应的监管部门或执法机构来执行处罚。

以您提供的两个参考信息为例：

1. 对未取得资质证书承揽工程的处罚：

   • 在这种情况下，责任主体是和林格尔县交通运输局，而非发证机关。交通运输局作为监管部门，负责调查、立案、审查、告知、决策、决定、送达和执行等处罚流程。
   • 处罚措施包括取缔、罚款以及没收违法所得等，这些措施由交通运输局根据相关法律法规执行。

2. 对以欺骗手段取得资质证书承揽工程的处罚：

   • 同样，责任主体也是和林格尔县交通运输局。
   • 处罚措施更为严厉，包括吊销资质证书、罚款以及没收违法所得等。这些处罚也是由交通运输局负责执行。

从这两个例子中可以看出，资质处罚的主体通常是负责监管特定行业或领域的政府部门或执法机构，而不是发证机关本身。发证机关主要负责颁发资质证书，并对证书的有效性进行管理，但在违规行为发生后，处罚的执行通常由监管部门或执法机构来负责。

因此，资质处罚的主体并不一定是发证机关，而是根据具体情况由相应的监管部门或执法机构来执行处罚。如果您或您的企业面临资质处罚的问题，建议咨询相关监管部门或法律专业人士，以了解具体的处罚流程和应对措施。