政府扶持项目立项转让的合法性需根据具体情况判断，其核心法律依据及分析如下：
一、合法性判断的核心依据
项目性质与合同约定
政府扶持项目通常涉及公共利益或特定政策目标（如科技创新、产业升级、扶贫开发等）。若项目立项时明确约定“禁止转让”或“转让需经政府批准”，则未经批准的转让行为可能因违反合同约定而无效。
法律依据：根据《民法典》第五百四十三条，当事人协商一致可以变更合同，但涉及公共利益或需行政许可的合同，变更需符合法定程序。
行政许可与审批要求
若项目立项需政府行政许可（如立项审批、资金拨付等），则转让行为可能涉及行政许可的变更。根据《行政许可法》第四十九条，被许可人需向作出行政许可的机关申请变更许可，未经批准擅自转让的，可能面临行政处罚（如撤销许可、罚款等）。
示例：某科技扶持项目立项时明确要求资金用于特定研发方向，若企业未经批准将项目转让给其他主体，可能因改变资金用途被撤销立项资格。
招投标与公平竞争原则
若项目通过招投标方式确定实施主体，转让行为可能违反《招标投标法》第四十八条，即“中标人不得向他人转让中标项目，也不得将中标项目肢解后分别向他人转让”。违反者可能面临中标无效、罚款等后果。
例外情形：经招标人书面同意，中标人可将部分非主体、非关键性工作分包，但分包人仍需具备相应资质。
二、合法转让的例外情形
政府书面同意或追认
若项目合同或行政许可中未明确禁止转让，且转让行为经政府书面同意（如补充协议、变更批复等），则转让可能被认定为合法。
操作建议：转让前应与政府主管部门沟通，明确转让条件、程序及后续责任承担，并签订书面协议。
项目公司股权转让
若项目通过设立项目公司实施，且政府扶持资金或政策针对的是项目公司而非特定股东，则股东通过股权转让方式退出项目，通常不视为项目转让，无需政府另行批准。
风险提示：需审查项目合同是否约定“股权变更需政府同意”，避免因违反合同条款导致纠纷。
三、法律后果与风险防范
民事责任
若转让行为被认定无效，转让方与受让方可能需承担返还财产、赔偿损失等责任。
示例：受让方已投入资金但项目被撤销的，可要求转让方返还投资并赔偿利息损失。
行政责任
未经批准擅自转让的，政府可能责令改正、没收违法所得、罚款，甚至撤销项目立项资格。
数据参考：根据《政府投资条例》第三十四条，项目单位擅自变更建设地点或规模的，可处项目总投资额1‰以上5‰以下的罚款。
刑事责任
若转让行为涉及虚构项目、骗取政府资金等情形，可能构成诈骗罪或合同诈骗罪，最高可处无期徒刑。
典型案例：某企业通过伪造材料获取扶贫项目立项后转让牟利，负责人被以诈骗罪判处有期徒刑十年。
四、实务建议
如需进一步分析具体项目情况，可直接向我咨询，我将结合项目性质、合同条款及地方政策提供针对性建议。