您好，关于您提出的“工伤认定是否可以在公司注册地”的问题，这主要取决于公司的参保情况以及实际的生产经营地。

首先，如果公司已经为员工在注册地参加了工伤保险，那么在发生工伤事故后，员工或其家属应当向公司注册地的工伤保险部门申请工伤认定。

然而，在实际情况中，很多公司的注册地与实际的生产经营地并不一致。特别是对于那些异地用工、异地营业或异地建设的公司来说，这种情况更为普遍。在这种情况下，如果公司没有为员工在注册地或生产经营地参加工伤保险，那么根据相关规定，工伤认定应当在生产经营地进行。

“生产经营地”通常指的是公司具体生产、经营、办公的所在地。对于存在相对固定工作场所的员工来说，该工作场所就可以视为生产经营地。例如，在您提到的案例中，吴某作为船员，在船舶停靠的港口（即宜昌市）发生工伤事故，而该港口可以视为其实际提供劳动的场所，也就是生产经营地。因此，吴某向宜昌市的人力资源和社会保障局申请工伤认定是符合规定的。

此外，如果用人单位的生产经营地涉及两个或两个以上的行政区，且各区的人力资源和社会保障局对受理管辖有争议，那么它们应当协商处理。如果协商不成，可以报请市人力资源社会保障局指定管辖。

综上所述，工伤认定并不一定非要在公司注册地进行，而是应当根据公司的参保情况以及实际的生产经营地来确定。如果公司未为员工参加工伤保险，且生产经营地不在注册地，那么员工或其家属应当向生产经营地的工伤保险部门申请工伤认定。希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。