关于全年工资不超过6万后来超过的问题，这主要涉及到个人所得税的计算与申报，以及可能涉及的劳动合同或公司薪酬制度调整等方面，以下分情况详细说明：

1. 个人所得税角度：

   • 税率变化：根据个人所得税法，工资薪金所得适用超额累进税率。如果全年工资原本不超过6万（即月均5000元，假设不考虑专项扣除等），可能处于较低税率档次。但当工资超过6万后，超出部分将按照更高的税率进行计税。
   • 申报调整：随着工资的增加，个人需要在年度汇算清缴时，根据实际收入情况调整应纳税额。如果平时按月预缴税款时未充分考虑全年收入情况，年度汇算时可能需要补缴税款或申请退税。
   • 计算公式示例（假设不考虑专项扣除、专项附加扣除等）：
     • 若全年工资为W元，且W > 60000元，则应纳税所得额 = W - 60000（起征点）- 其他可能的扣除项（如社保、公积金等，此处简化不计）。
     • 应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数（税率和速算扣除数根据应纳税所得额确定）。

2. 劳动合同或公司薪酬制度角度：

   • 合同变更：如果工资的增加是由于劳动合同中的薪酬条款变更，那么双方应签订书面变更协议，明确新的薪酬标准和支付方式。
   • 公司制度：如果工资增加是公司根据内部薪酬制度或绩效考核结果进行的调整，那么员工应了解并遵守公司的相关规定，同时确认调整后的工资是否已正确反映在工资条或银行流水上。

3. 法律建议：

   • 保留证据：无论工资增加的原因是什么，员工都应保留好相关的证据，如劳动合同、工资条、银行流水等，以备不时之需。
   • 及时沟通：如果员工对工资的增加有疑问或不满，应及时与公司的人力资源部门或财务部门进行沟通，了解具体情况并寻求解决方案。
   • 关注税务：随着工资的增加，员工应更加关注个人所得税的申报和缴纳情况，确保自己的税务合规。

总结来说，全年工资从不超过6万到超过6万，主要影响的是个人所得税的计算与申报，以及可能涉及的劳动合同或公司薪酬制度的调整。员工应了解并遵守相关的法律法规和公司制度，保留好相关证据，及时沟通并关注税务情况。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。