企业辞退55岁以上员工，其补偿金是需要扣税的，但具体扣税方式需根据补偿金的性质及金额来确定。以下是对这一问题的详细分析：
一、补偿金扣税的基本原则
根据《中华人民共和国个人所得税法》及相关规定，个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入（包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用），在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过的部分则需要按照相关规定计算征收个人所得税。
二、补偿金扣税的具体计算
免税部分：
- 如果补偿金不超过当地上年职工平均工资的3倍，那么这部分补偿金是免征个人所得税的。
应税部分：
- 如果补偿金超过当地上年职工平均工资的3倍，那么超出的部分需要按照“工资、薪金所得”项目计征个人所得税。
- 具体计算时，应将超出部分除以个人在本企业的工作年限数（最高不超过12年），以其商数作为个人的月工资、薪金收入，按照税法规定计算缴纳个人所得税。
计算公式：
- 应纳税所得额 = 一次性补偿收入 - 当地上年职工平均工资×3
- 应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数
- 其中，适用税率和速算扣除数根据应纳税所得额对应的税率表来确定。
三、特殊情况考虑
55岁以上员工的特殊性：
- 年龄本身并不直接影响补偿金的扣税，但55岁以上员工可能因接近退休年龄而在计算工作年限时有所考虑（如工作年限可能较短，从而影响应税部分的计算）。
- 如果员工已经达到或超过法定退休年龄，并且已经依法享受养老保险待遇或领取退休金，那么其与企业之间的劳动关系可能被视为终止，此时取得的补偿金可能不适用上述扣税规定，而是按照其他相关规定处理。
补偿金与工资福利的区别：
- 补偿金是因解除劳动关系而取得的，与正常的工资福利不同。工资福利是员工在职期间因提供劳动而获得的报酬，而补偿金则是对员工因劳动关系解除而遭受的损失的补偿。
四、法律建议
了解当地政策：
- 由于不同地区的职工平均工资可能存在差异，因此建议员工在计算补偿金扣税时，先了解当地的上年职工平均工资水平。
保留相关证据：
- 员工应保留好与企业解除劳动关系的证明文件以及补偿金的支付凭证，以便在需要时进行税务申报或维权。
咨询专业人士：
- 如果员工对补偿金的扣税问题存在疑问或不确定如何计算，建议咨询专业的税务人员或律师，以确保自己的权益得到保障。
总结：企业辞退55岁以上员工时，其补偿金在超过当地上年职工平均工资3倍的部分是需要扣税的。具体扣税方式需根据补偿金的性质及金额来确定，并遵循相关的税法规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。