工期违约金的诉讼时效起算时间并不是绝对地在工程竣工之后开始。具体分析如下：
诉讼时效起算点的确定
在建筑工程合同工期违约金纠纷中，诉讼时效的起算点通常基于以下情况来确定：
合同约定明确的竣工日期：若合同明确约定了竣工日期，而施工方未能按时竣工，则从约定的竣工日期届满之日起，发包方一般就知道或应当知道其权利受到损害，此时诉讼时效开始计算。
工程实际竣工后确定工期违约：在某些情况下，工期违约可能要到工程实际竣工后，通过对施工过程的资料审查、核算等才能确定。此时，诉讼时效从确定工期违约事实之日起计算。也就是说，如果承包人违约的状态一直在持续，究竟承包人违约多少天，发包人要等到工程实际竣工时才能计算出来，故诉讼时效的起算点应从工程实际竣工之日开始。
双方持续协商过程：若施工过程中双方就工期延误问题一直在进行协商，且未明确达成一致处理意见，诉讼时效可能会因当事人一方提出要求或同意履行义务而中断，并从中断时起重新计算。
诉讼时效的相关规定
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一规定同样适用于建筑工程合同工期违约金纠纷。同时，若自权利受到损害之日起超过二十年，人民法院将不予保护，但在特殊情况下，人民法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效。
综上所述，工期违约金的诉讼时效起算时间并非绝对地在工程竣工之后开始，而是根据具体情况来确定。如果您在实际操作中遇到此类问题，建议结合合同约定、法律规定以及实际情况来综合判断，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。