交通事故救助金垫付后，保险公司在理赔时是否会划扣，需分情况讨论：

1. 救助金性质为借款或需返还的
   若救助金属于政府或社会机构提供的临时垫付（如道路交通事故社会救助基金），且明确约定需在赔偿款中优先返还，则保险公司在理赔时会根据责任划分，从应赔付给受害方的款项中直接划扣相应金额，返还给救助基金管理方。例如：受害方无责，但救助基金垫付了医疗费，保险公司需在全责方（如肇事司机）的保险限额内，将垫付款返还给基金。

2. 救助金性质为无偿补助的
   若救助金为慈善机构或政府提供的无偿补助（不要求返还），则保险公司理赔时不会划扣。此时，受害方获得的救助金与保险赔偿款互不影响，受害方可同时获得救助金和保险赔偿。

3. 责任方与受害方身份重叠时
   若受害方本身对事故负有责任（如行人闯红灯被撞），且救助金垫付了其医疗费，保险公司可能根据责任比例调整赔偿。例如：受害方承担30%责任，保险公司仅需赔偿其70%损失，若救助金已全额垫付，保险公司可能从赔偿款中划扣30%的垫付款（按责任比例返还）。

关键提醒：

• 救助金是否需返还，需以垫付协议或地方规定为准，建议保留垫付凭证及协议原件。
  
• 保险公司划扣前，通常会与受害方、救助基金管理方协商，若对划扣金额有异议，可要求保险公司提供计算依据。
  
• 若事故涉及多方责任（如多方车辆），需按责任比例分摊救助金返还义务。
  

建议：若您遇到救助金划扣争议，可提供垫付协议、事故责任认定书等材料，我将进一步分析具体操作是否合法合规。