交通事故协商赔偿后，是否需要去撤案，取决于事故的具体情况和是否已经正式立案。以下是对这一问题的详细分析：
一、不需要撤案的情况
轻微事故未立案：
- 对于轻微的交通事故，如两车间的轻微刮擦，若双方能当场协商一致并履行赔偿等事宜，且事故未造成人员伤亡或车辆严重损坏，通常无需专门到交警部门撤案。此类事故往往未正式立案，或即便有登记也因情节轻微且已解决，不会对双方产生后续影响。
自行协商解决：
- 如果双方选择自行协商解决，并未通过交警部门进行正式处理，那么也就不存在撤案的问题。双方只需按照协商达成的赔偿协议履行各自义务即可。
二、需要撤案的情况
已正式立案的事故：
- 若交通事故涉及人员伤亡、车辆严重损坏等严重情况，且已由交警正式立案处理，双方在协商解决（如达成赔偿协议并履行）后，需要前往交警部门说明情况并办理撤案手续。这是因为此类事故已进入正式处理程序，有相应记录和档案，完成撤案手续可确保事故在交警系统中得到明确处理，避免后续麻烦。
涉及治安案件：
- 如果事故中双方发生了冲突，且该冲突已被公安机关作为治安案件立案处理，那么双方在协商解决后，也需要根据《公安机关办理行政案件程序规定》申请撤案。具体流程包括双方当事人书面申请，并提交和解协议及其他相关材料至公安机关，经审核确认无误后方可撤案。
三、撤案的法律意义与注意事项
法律意义：
- 撤案意味着事故在法律上得到了正式解决，双方的权利义务关系得到明确，避免了后续可能出现的法律纠纷。
注意事项：
- 在办理撤案手续时，双方应确保赔偿协议已经履行完毕，且没有遗留问题。
- 如果事故中存在欺诈、胁迫等情形导致赔偿协议可撤销，那么应在撤销协议后再办理撤案手续。
- 撤案后，双方应保留好相关证据和文件，以备不时之需。
举例说明：
- 假设两车发生轻微刮擦，双方当场协商一致并赔偿了对方损失，且未报警或交警未到场处理。这种情况下，双方无需去交警部门撤案。
- 假设两车发生严重碰撞，造成人员伤亡和车辆严重损坏，且交警已到场处理并正式立案。双方在协商解决后，需要前往交警部门说明情况并办理撤案手续。
建议：
- 在处理交通事故时，无论事故轻重，都建议及时报警并等待交警到场处理。这样不仅可以确保事故得到妥善处理，还可以避免后续可能出现的法律纠纷。
- 如果双方选择自行协商解决，也建议在协商过程中保持冷静和理性，确保赔偿协议的公平性和合理性。同时，在协商解决后，及时与交警部门沟通并办理相关手续。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。