当您发现合同中的定金超过了主合同标的额的20%时，这确实是一个需要仔细处理的问题。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，定金数额不得超过主合同标的额的20%，超出部分不产生定金的法律效力。接下来，我将为您详细阐述如何处理这种情况：
一、明确超出部分的性质
首先，要明确超出20%的定金部分在法律上并不被视为定金，而是可能被视为预付款或其他性质的款项。这意味着，这部分款项不受定金罚则的约束，即不会因违约而双倍返还或不予返还。
二、双方协商调整
友好沟通：建议您与合同对方进行友好沟通，说明定金超过法定比例的情况，并表达希望调整定金数额的意愿。
重新约定：在协商过程中，双方可以就定金数额达成新的协议，确保定金不超过主合同标的额的20%。这一变更应以书面形式进行，如签订补充协议或修改原合同，以确保其法律效力。
处理超出部分：对于超出20%的部分，双方可以协商将其转化为预付款、货款或其他形式的款项，并在合同中明确约定其性质和处理方式。
三、特殊情况下的处理
主合同无效或未签订：如果主合同尚未签订或无效，那么您可以要求对方退还超过20%的定金部分，因为此时定金合同失去了存在的基础。
双方有明确约定：尽管定金给付超过了20%，但如果双方在合同中对此有明确的约定，并且该约定不存在欺诈、胁迫等导致合同可撤销的情形，那么该约定可以被视为对定金合同的变更，超出部分不一定需要退回。但这种情况较为特殊，需要谨慎处理。
合同可撤销情形：如果存在欺诈、胁迫等导致合同可撤销的情形，您作为受损害方可以向法院请求撤销该定金合同，并要求对方退还全部定金（包括超出20%的部分）。
四、按照法律规定处理违约情况
收受定金方违约：如果收受定金的一方不履行债务或者履行债务不符合约定，致使不能实现合同目的的，应当双倍返还定金（但仅限于不超过主合同标的额20%的部分）。对于超出部分，收受方应原数返还。
给付定金方违约：如果给付定金的一方不履行债务或者履行债务不符合约定，致使不能实现合同目的的，无权请求返还定金（同样仅限于不超过主合同标的额20%的部分）。对于超出部分，给付方有权要求收受方返还。
五、通过法律途径解决纠纷
如果双方就定金问题无法协商一致，您可以通过向人民法院提起诉讼或依据仲裁协议申请仲裁的方式解决。在诉讼或仲裁过程中，您需要提供充分的证据（如合同、支付凭证、沟通记录等）来证明自己的主张，并依据相关法律规定来维护自己的合法权益。
六、注意事项与风险防范
明确约定：在签订合同时，务必明确约定定金的具体数额和性质，避免后续纠纷。
保留证据：处理定金纠纷时，应妥善保存合同、支付凭证、沟通记录等相关证据，以备不时之需。
及时行动：发现定金超出法定范围时，应及时采取措施进行处理，避免损失扩大。
综上所述，当定金超过主合同标的额的20%时，您应首先与对方进行友好协商，并尝试通过调整定金数额或处理超出部分来解决问题。如果协商无果，您可以依据法律规定处理违约情况或通过法律途径解决纠纷。在处理过程中，务必注重明确约定、保留证据，并遵守相关法律法规以维护自身合法权益。