在城市范围内，违法建筑的认定主要由城乡规划主管部门、乡镇人民政府以及其他相关部门（如自然资源部门、住建部门等）根据各自职责和权限进行。以下是具体说明：

1. 城乡规划主管部门

   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
   • 职责范围：城乡规划主管部门主要负责城市规划区内违法建筑的认定，包括未批先建、超面积建设等行为。它们通过现场勘查、调取规划许可文件等方式，对建筑物的合法性进行评估，并作出相应的处理决定。

2. 乡镇人民政府

   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条，在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。
   • 职责范围：乡镇人民政府则针对农村集体土地上未经审批擅自搭建的建筑物、构筑物进行认定。它们在乡、村庄规划区内行使违法建筑认定的职权，确保农村地区的建筑活动符合规划要求。

3. 其他相关部门

   • 自然资源部门：对涉及非法占用土地（如耕地、林地）的违建行为进行查处。根据《土地管理法》第七十七条，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。
   • 住房和城乡建设部门：参与认定违反施工许可管理规定的建设项目。例如，未办理施工许可证擅自开工的工程，可能由住房和城乡建设部门进行查处。

认定流程与协作机制：

• 线索发现：通过群众举报、日常巡查、卫片执法等途径获取疑似违建信息。
• 调查取证：现场勘查核实建筑位置、面积、用途等基础数据，调取用地审批文件、规划许可证明等材料。
• 联合认定：复杂案件需多部门协同研判，例如自然资源部门确认土地性质，城管部门评估建筑安全性。
• 公示告知：将认定结果向社会公开，保障当事人陈述申辩权利。

特殊情形下的认定主体差异：

• 历史遗留问题：部分早期建设的无证房屋可能因政策调整被纳入合法化范畴，需结合当地专项整治方案确定处理方式。
• 跨区域违建：跨行政区域的违法建筑由共同上级政府指定管辖机关，避免推诿扯皮。

在实际操作中，如果发现疑似违法建筑，建议首先向当地的城乡规划主管部门或乡镇人民政府咨询，了解具体的认定流程和所需材料。同时，也可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到妥善维护。如果你有任何关于房产问题的法律疑问，可以直接向我咨询。