工伤期间不上班打卡是否合法，需根据具体情况来判断。以下从不同角度进行分析：

一、工伤停工留薪期内的情形

在工伤停工留薪期内，员工因工伤需要暂停工作接受工伤医疗的，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。在此期间，员工无需上班打卡，因为其正处于治疗和恢复阶段，无法正常出勤。这是根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，该条款明确指出，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付，且停工留薪期一般不超过12个月。

二、工伤医疗期结束后的情形

1. 若员工医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的：

   • 根据《工伤保险条例》的相关规定，用人单位可以提前30日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。但在此之前，若员工仍处于无法工作的状态，且未与用人单位就复工事宜达成一致，那么员工不上班打卡可能并不直接构成违法，但需注意，这并不意味着员工可以无限期地不上班。用人单位有权根据员工的实际恢复情况和工作需要，合理安排员工的工作岗位或任务。

2. 若员工医疗期满后能够从事原工作或用人单位另行安排的工作的：

   • 员工应当按照用人单位的规定上班打卡，履行工作职责。若员工无正当理由拒绝上班打卡或拒绝从事用人单位安排的工作，那么用人单位有权依据内部规章制度对员工进行处理，包括但不限于警告、罚款、解除劳动合同等。

三、特殊情况下的处理

• 若员工因工伤导致长期无法出勤，且双方对复工事宜存在争议：建议员工与用人单位进行协商，寻求合理的解决方案。如协商不成，员工可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
• 若员工认为用人单位的处理方式不当或存在违法行为：员工有权向当地劳动保障监察部门投诉，或者依法提起劳动诉讼，维护自己的合法权益。

总结与建议：

• 在工伤停工留薪期内，员工无需上班打卡，享受原工资福利待遇。
• 医疗期满后，若员工能够从事原工作或用人单位另行安排的工作，应当按照用人单位的规定上班打卡。
• 若双方对复工事宜存在争议，建议通过协商、调解或仲裁等方式解决。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。