关于劳务派遣的残疾人人数在申报时的计入问题，这确实是一个需要细致考虑和遵循相关法律法规的流程。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们要明确的是，在职职工人数的计算以及劳务派遣方式下招用残疾人数量的计入方法，都是需要严格遵循相关法律法规，并考虑双方协议及地方政策的具体规定的。
对于在职职工人数，它通常指的是用人单位在编人员或依法与用人单位签订1年以上（含1年）劳动合同（服务协议）的人员，这包括了全职和兼职员工。在计算时，我们会按照全年各月在职职工人数总和除以12来确定年平均在职职工人数。这个数值是企业在申报残疾人就业保障金等事务中的重要数据基础，会直接影响企业应缴纳的保障金金额。
接下来，我们重点讨论劳务派遣方式下招用残疾人数量的计入方法。在劳务派遣这种特殊用工方式中，被派遣劳动者虽然在实际用工单位工作，但他们与劳务派遣公司签订了劳动合同，因此从法律关系上来说，他们属于劳务派遣公司的在职职工。关于被派遣的残疾人数量如何计入，这主要取决于劳务派遣公司和实际用工单位之间的约定：
如果双方协商一致：劳务派遣公司和实际用工单位可以通过签订协议的方式，明确约定被派遣劳动者中的残疾人计入哪一方的在职职工残疾人人数。例如，双方可以约定被派遣的2名残疾人计入实际用工单位的残疾人人数。在这种情况下，实际用工单位在申报残疾人就业保障金时，就可以将这2名残疾人计入本单位实际安排残疾人就业人数。
如果未约定或约定不明：如果双方未就残疾人计入问题进行约定或约定不明确，那么根据相关规定，被派遣的残疾人应计入劳务派遣公司的在职职工残疾人人数。这意味着，在没有明确约定的情况下，派遣的残疾人算作劳务派遣公司安排的残疾人就业人数，由劳务派遣公司在申报残疾人就业保障金时进行相应抵扣。
最后，我想提醒您的是，由于具体计算和申报方式可能受到地方政策的影响，因此建议您在操作前仔细查阅所在地的相关法规和政策文件。同时，为了确保双方的权益和避免后续可能出现的争议和纠纷，建议您与劳务派遣公司明确约定残疾人计入问题。如果在实际操作中有任何疑问或不确定之处，建议及时咨询当地的残联、税务部门或专业法律机构，以确保准确理解和遵守相关规定。