在商标行政案中，如果原告一审起诉国知局，被告作为第三人，在二审中被告提起上诉，那么被上诉人将是原审原告，即一审中起诉国知局的那一方。

分析说明：

1. 一审地位：在一审中，原告是提起诉讼的一方，国知局是被诉的行政机关，而被告则是作为与案件有利害关系的第三方参与诉讼。

2. 二审上诉：当一审判决作出后，如果被告（第三人）对判决不服，可以在法定期限内提起上诉。此时，被告（第三人）成为上诉人。

3. 被上诉人确定：在二审中，被上诉人是指与上诉人相对的一方当事人。由于一审中原告是提起诉讼的一方，且二审是基于一审的判决进行的，因此，当被告（第三人）提起上诉时，原审原告自然成为被上诉人。

法律依据：

• 《中华人民共和国行政诉讼法》第二十九条：公民、法人或者其他组织同被诉行政行为有利害关系但没有提起诉讼，或者同案件处理结果有利害关系的，可以作为第三人申请参加诉讼，或者由人民法院通知参加诉讼。人民法院判决第三人承担义务或者减损第三人权益的，第三人有权依法提起上诉。

综上所述，在商标行政案中，如果被告（第三人）在二审中提起上诉，那么被上诉人将是原审原告。如果你对此问题或相关法律问题有任何疑问，欢迎直接向我咨询。