在知识产权案件中，如果起诉方注销，其主张起诉的案件是否还有效，这是一个涉及诉讼主体资格和诉讼程序连续性的问题。以下是对此问题的详细解答：

首先，明确结论：

起诉方注销后，其主张起诉的案件并不因此自动失效，但案件的后续处理会受到一定影响，具体取决于注销的性质、时间以及案件所处的诉讼阶段。

接下来，分情况详细解释：

1. 注销性质的影响：

   • 如果起诉方的注销是合法的，并且已经完成了清算程序，那么其法人资格将终止。在这种情况下，如果案件尚未开庭审理，法院可能会要求起诉方的权利义务承受人（如股东、清算组等）参与诉讼，或者由他们决定是否继续诉讼。
   • 如果起诉方的注销是非法的，或者存在未了结的诉讼事项而未经法院同意即进行注销，那么法院可能会视情况而定，可能中止诉讼，等待相关问题的解决，或者由相关权利人申请恢复诉讼。

2. 诉讼阶段的影响：

   • 如果案件已经开庭审理，并且起诉方的注销发生在诉讼过程中，那么法院可能会根据案件的实际情况，决定是否需要中止诉讼，或者由起诉方的权利义务承受人继续参与诉讼。
   • 如果案件已经作出判决，但起诉方在判决生效前注销，那么判决的效力可能会受到影响。在这种情况下，起诉方的权利义务承受人可能需要承担判决所确定的义务，或者通过法律程序对判决提出异议。

3. 法律建议：

   • 对于起诉方而言，在注销前应当妥善处理好未了结的诉讼事项，确保不会因注销而影响案件的审理和判决的执行。
   • 对于被告方而言，如果面临起诉方注销的情况，应当及时与法院沟通，了解案件的处理进展，并根据实际情况采取相应的法律措施。

综上所述，起诉方注销后，其主张起诉的案件并不因此自动失效，但案件的后续处理会受到一定影响。具体处理方式需要根据注销的性质、时间以及案件所处的诉讼阶段来确定。如果您面临类似情况，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和指导。