知识产权侵权案件中，五个被告可以一起进行总的调解。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律程序上的可行性

在知识产权侵权诉讼中，如果存在多个被告，且这些被告的侵权行为相互关联或构成共同侵权，那么从法律程序的角度来看，这些被告是可以一起进行调解的。调解作为一种非诉讼纠纷解决方式，具有灵活性和高效性，能够迅速解决纠纷，减少当事人的诉讼成本和时间。在调解过程中，各方可以就侵权事实、赔偿金额、道歉方式等关键问题进行协商，并达成调解协议。

二、调解协议的法律效力

一旦各方达成调解协议，该协议即具有法律效力。这意味着，如果任何一方不履行调解协议中的义务，另一方可以依据调解协议向法院申请强制执行。因此，从法律效力的角度来看，一起进行总的调解是可行的，并且能够确保调解结果的执行。

三、实际操作中的注意事项

1. 明确侵权事实和责任： 在调解前，需要明确每个被告的侵权事实和责任。这有助于在调解过程中合理分配赔偿金额和其他责任，确保调解结果的公平性和合理性。

2. 协商一致原则： 调解需要各方协商一致。因此，在调解过程中，需要充分听取各方的意见和诉求，寻求共同的利益点，以达成调解协议。

3. 调解协议的合法性和有效性： 调解协议需要符合法律法规的规定，不得违反公序良俗。同时，调解协议需要明确各方的权利和义务，以及违约责任和争议解决方式等条款，以确保调解协议的有效性和可执行性。

4. 法院或仲裁机构的确认： 虽然调解协议本身具有法律效力，但为了确保其权威性和执行力，建议将调解协议提交给法院或仲裁机构进行确认。这样，如果任何一方不履行调解协议，另一方可以依据确认后的调解协议向法院申请强制执行。

四、调解的优势

与诉讼相比，调解具有以下优势：

1. 灵活性： 调解过程更加灵活，可以根据各方的需求和实际情况进行调整和协商。

2. 高效性： 调解能够迅速解决纠纷，减少当事人的诉讼成本和时间。

3. 保密性： 调解过程通常保密，有助于保护各方的商业秘密和隐私。

4. 维护关系： 调解有助于维护各方之间的商业关系或人际关系，避免因诉讼而导致的长期对立和冲突。

建议：在知识产权侵权案件中，如果存在多个被告，且这些被告的侵权行为相互关联或构成共同侵权，那么可以考虑一起进行总的调解。在调解过程中，需要明确侵权事实和责任、遵循协商一致原则、确保调解协议的合法性和有效性，并考虑将调解协议提交给法院或仲裁机构进行确认。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。