当两个单位一起申请软件著作权时，你们需要共同准备并提交一系列的申请材料。以下是详细的申请资料清单及说明：
一、基本材料
《计算机软件著作权登记申请表》：
- 这是申请软件著作权的核心表格，需要详细填写软件名称、版本号、开发完成日期、首次发表日期等基本信息。
- 由于是两个单位共同申请，需在申请表中明确标注“合作开发”或“共同申请”，并列出两个单位的名称和相关信息。
软件鉴别材料：
- 源程序代码：提供软件源程序代码的前30页和后30页（如果总页数不足60页，则全部提交）。
- 文档材料：包括操作手册、用户手册或设计说明书等文档的前30页和后30页（同样，如果总页数不足60页，则全部提交）。
- 这些材料用于证明软件的原创性和功能性，是申请软件著作权的重要依据。
申请人身份证明：
- 两个单位均需提供各自的营业执照副本复印件或其他有效身份证明文件，以证明其合法身份和申请资格。
二、权利归属证明
- 合作开发合同：
- 这是两个单位共同申请软件著作权的关键文件，需要明确双方的合作方式、权利义务分配、著作权归属等条款。
- 合同应详细、清晰，并由双方单位盖章确认，以确保其法律效力。
三、提交申请
在线提交：
- 你们可以通过中国版权保护中心的“中国版权登记大厅”平台注册账号，在线填写并提交申请信息，同时上传准备好的申请材料。
- 在线提交方便快捷，可以实时跟踪申请进度。
线下提交：
- 如果选择线下提交，你们需要将纸质申请材料整理齐全，并提交至北京的中国版权保护中心办事窗口，或者通过邮寄方式寄送至指定地址。
- 线下提交需要注意材料的完整性和准确性，以及邮寄过程中的安全性和时效性。
四、后续流程
- 受理与审查：中国版权保护中心会对提交的申请材料进行形式审查和实质审查，确保材料的齐全性和规范性，以及软件的原创性和功能性。
- 缴费：根据申请的软件著作权登记费用标准，你们需要缴纳相应的申请费。缴费方式多样，可以选择银行转账、邮局汇款或在线支付等。
- 补正（如需）：如果在审查过程中发现材料不符或需要补充材料，你们需要按照补正通知书的要求进行补正，并重新提交审查。
- 登记与发证：经审查无误后，中国版权保护中心会在规定时间内颁发《计算机软件著作权登记证书》。你们可以选择自行到版权保护中心领取或邮寄领取。
总结
两个单位一起申请软件著作权需要共同准备并提交一系列的申请材料，包括基本材料、权利归属证明等。在提交申请时，可以选择在线提交或线下提交方式。后续流程包括受理与审查、缴费、补正（如需）以及登记与发证等步骤。通过遵循上述流程，你们可以有效保障两个单位的合法权益，为共同开发的软件作品提供法律保护。