针对您提出的“股东仅提交备注资金证明是否有效”的问题，这涉及到股东出资的实质性验证与法律认定，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，股东出资是设立有限责任公司的法定必经程序，它构成了公司的注册资本，是公司开展生产经营活动和对外承担责任的基础。根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，股东应当按期足额缴纳公司章程规定的各自所认缴的出资额。对于货币出资，股东应当将货币出资足额存入有限责任公司在银行开设的账户。

现在，我们具体分析您提出的问题。股东仅提交备注资金证明，而实际上资金并未在公司账户中留存，或者留存后迅速转出，这种行为在法律上并不能被认定为有效的出资。因为出资的实质是股东将资金实际投入到公司中，用于公司的运营和发展，而不仅仅是形式上的转账或备注。

以您提供的参考信息中的案例为例，股东孟某和王某虽然将资金转入了公司账户，并备注了出资款，但这些资金在转入后随即被转出，且未用于公司的正常经营。法院在审理此案时认为，这种行为有违常理，存在恶意转移或规避法律风险的倾向，因此并未认定其出资到位。股东孟某和王某需要在其未出资范围内对公司债务承担补充赔偿责任。

此外，我们还需要注意，即使股东提交了资金证明，但如果该资金并未实际用于公司的运营，或者存在其他违反法律、行政法规或公司章程的行为，那么这种出资也可能被认定为无效。例如，股东利用虚构的债权债务关系、关联交易等方式将出资转出，导致公司“空壳化”，这种行为不仅会影响公司的运营和市场交易信誉，还可能构成违法犯罪。

综上所述，股东仅提交备注资金证明并不能被视为有效的出资。股东应当确保资金实际投入到公司中，并用于公司的正常经营和发展。如果股东存在恶意转移资金、规避法律风险等行为，那么他们将需要承担相应的法律责任。希望这个解答能够帮助您更好地理解股东出资的法律要求和实质性验证。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。