在孕晚期，如果因为身体不舒服而需要请假，是否扣工资主要取决于您请的是哪种类型的假以及您所在单位的具体政策和所在地区的法律法规。

首先，如果您的情况符合产假的条件，即您即将分娩或已经分娩，那么根据《女职工劳动保护特别规定》，您有权享受一定天数的产假，且在产假期间，您享有与在岗时同等的工资待遇，这包括基本工资、津贴和补贴等。这是为了保障女职工在生育期间的经济权益。如果您的单位为您缴纳了生育保险，产假期间的工资通常由生育保险基金支付；如果未缴纳或支付不足，单位需要按照您产假前的工资标准补足差额。

然而，如果您在孕晚期身体不舒服，但还未到预产期，且医生诊断您需要休息，这可能属于病假范畴。在病假期间，根据相关规定，用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资。当然，具体支付比例可能因地区和单位政策而异，您需要查阅您所在单位的相关规定或咨询人力资源部门。

另外，如果您请的是事假，即非因病或非因生育需要的请假，那么用人单位有权不支付事假期间的工资。但请事假通常不会计入产假天数内，也不会影响您未来享受产假的权益。

总结来说：

1. 如果您请的是产假，且符合相关规定，那么通常不会扣工资。
2. 如果您请的是病假，用人单位需要按照不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资（具体比例可能因地区和单位政策而异）。
3. 如果您请的是事假，用人单位有权不支付事假期间的工资。

为了确保您的权益得到保障，我建议您在请假前与您所在单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解具体的请假政策和工资支付规定。同时，您也可以咨询当地的劳动保障部门或法律援助机构，以获取更权威和专业的解答。