企业询证函一般没有强制要求必须一式两份，具体份数需根据实际情况和目的确定。以下从不同角度详细说明：

1. 从审计程序角度：在审计工作中，企业询证函是审计师为了验证企业账面记录的准确性，向第三方（如客户、供应商等）发送的确认函件。通常审计师会准备至少两份询证函原件，一份发送给被询证方，另一份作为工作底稿留存备查。但这不是法律强制要求，而是审计行业的操作惯例，目的是确保审计证据的完整性和可追溯性。若企业自行使用询证函进行内部核对或往来确认，份数可自行决定。

2. 从合同或交易角度：若询证函涉及合同履行、债权债务确认等法律关系，份数需根据合同约定或交易习惯确定。例如，若合同明确约定“双方各执一份原件”，则需一式两份；若未约定，双方可协商确定份数，通常以能满足双方留存证据需求为准（如一方留原件，另一方留复印件或扫描件）。

3. 从证据效力角度：若询证函需作为法律证据使用（如诉讼、仲裁），建议至少准备两份原件，一份用于提交法院/仲裁机构，另一份自行留存。原件的效力高于复印件，多份原件可避免因丢失或损毁导致证据不足的风险。

总结建议：

• 若为审计目的，按审计程序准备两份（一份发送，一份留存）；
  
• 若为合同或交易确认，根据合同约定或双方协商确定份数；
  
• 若需作为法律证据，建议准备两份原件并妥善保管。
  

如有具体场景或合同条款需要分析，可进一步向我说明，我会结合实务经验为您详细解答。