自书遗嘱原则上不能直接对家庭协议书中的共有房产进行变更，但可以通过遗嘱对个人在共有房产中的份额进行处分。以下从不同角度进行分析：

1. 家庭协议书与自书遗嘱的法律性质不同
   家庭协议书通常是家庭成员之间就共有财产的分割、使用、收益等达成的合意，属于合同性质，对协议各方具有约束力。而自书遗嘱是遗嘱人单方处分个人财产的法律行为，仅在遗嘱人死亡时生效。若家庭协议书已明确约定共有房产的归属或分割方式，遗嘱人不能通过遗嘱单方推翻协议内容，否则可能构成违约或侵权。

2. 遗嘱只能处分个人合法财产
   根据《民法典》第1133条，遗嘱人只能处分自己名下的财产。若房产为家庭共有（如夫妻共同财产、家庭共有财产），遗嘱人仅能对个人享有的份额作出处分。例如：

   • 夫妻共有房产中，一方仅能通过遗嘱处分其50%的份额；
     
   • 家庭共有房产中，遗嘱人需先明确个人份额（如通过协议或法定继承规则确定），再通过遗嘱处分该份额。
     若遗嘱试图处分他人份额，该部分内容无效。

3. 家庭协议书与遗嘱冲突时的处理规则

   • 协议优先原则：若家庭协议书已对房产分割作出明确约定（如“房产归子女共同所有”），遗嘱人无权通过遗嘱变更协议内容，否则可能引发继承纠纷。
     
   • 例外情形：若家庭协议书未明确约定房产归属，或遗嘱人通过合法途径（如赠与、买卖）取得房产全部所有权后，可通过遗嘱处分房产。

4. 实务建议

   • 明确财产份额：若需通过遗嘱处分共有房产，建议先通过家庭协议书或法律程序（如析产诉讼）明确个人份额，再订立遗嘱。
     
   • 公证增强效力：为避免争议，可对遗嘱进行公证，或通过律师见证确保遗嘱形式合法。
     
   • 协调家庭关系：若涉及多继承人，建议提前沟通，避免遗嘱内容与家庭协议冲突导致亲情破裂。

总结：自书遗嘱的效力范围限于遗嘱人个人财产，若需变更家庭协议书中的共有房产安排，需先通过合法途径明确个人份额，再通过遗嘱处分。如有具体案例或复杂情况，可进一步向我咨询。