结论前置：停工留薪期工资的计算基数一般不包含加班工资，而是按照工伤职工受伤前12个月的平均工资（剔除加班费后）来确定。

一、停工留薪期工资的计算基数

1. 基本规定：

   • 根据《工伤保险条例》第三十三条，职工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受治疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常指的是职工在正常工作状态下的工资，一般不包括加班工资。

2. 计算方式：

   • 若职工工作已满12个月，则按工伤前12个月应发工资的月平均工资计算，这个平均工资是剔除了加班费后的平均值。
   • 计算公式为：\(\text{月平均工资} = \frac{\text{受伤前12个月工资总额（剔除加班费）}}{12}\)。
   • 若职工工作未满12个月，则按工伤前实际工作月数应发工资的月平均工资计算，同样剔除加班费。

3. 最低保障原则：

   • 支付金额不得低于当地最低工资标准。例如，若某地最低工资为2300元/月，而职工原工资（剔除加班费后）仅2000元，单位仍需按2300元支付。

二、停工留薪期的确定与延长

1. 一般规定：

   • 停工留薪期一般不超过12个月，具体时长根据医疗机构出具的诊断证明等相关材料确定。

2. 延长条件：

   • 伤情严重或情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可适当延长，但延长不得超过12个月。

三、特殊情况处理

1. 法定节假日与年休假：

   • 若工伤职工在停工留薪期内遇到法定节假日、年休假等，工资仍应按正常标准支付，这里的正常标准同样是指剔除加班费后的平均工资。

2. 伤残等级评定后：

   • 工伤职工评定伤残等级后，停发原待遇，按照相关规定享受伤残待遇。从评定伤残等级的次月起，单位不再按照停工留薪期工资标准发放工资。

3. 继续治疗：

   • 若工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗，可继续享受工伤医疗待遇，但工资发放按伤残等级确定的相关待遇执行。

四、法律建议

1. 保留证据：

   • 工伤职工应保留好医疗诊断证明、工资条、劳动合同等材料，以便在需要时证明自己的权益。

2. 协商沟通：

   • 优先与单位协商解决停工留薪期工资的问题，避免矛盾激化。

3. 法律途径：

   • 若单位拒绝支付或支付不足，工伤职工可以向劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁，必要时提起诉讼来维护自己的合法权益。

举例说明：假设某职工月工资为8000元（其中基本工资5000元，加班费3000元），因工伤需停工治疗6个月。其停工留薪期工资应按剔除加班费后的月平均工资（即5000元）来计算，每月支付5000元，而非8000元。若单位仅支付基本工资4000元，则属于违法行为，职工可通过劳动仲裁主张补发差额。

总结：停工留薪期工资的计算基数一般不包含加班工资，而是按照工伤职工受伤前12个月的平均工资（剔除加班费后）来确定。工伤职工应了解自己的权益，并在遇到问题时及时通过合法途径维护自己的利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。