结论：超载百吨被交警处罚三次且每次都卸货，是否构成危险作业罪不能一概而论，需要结合具体情形判断。以下从不同角度为你详细分析：

危险作业罪的构成要件

根据《中华人民共和国刑法》第一百三十四条之一规定，在生产、作业中违反有关安全管理的规定，有下列情形之一，具有发生重大伤亡事故或者其他严重后果的现实危险的，处一年以下有期徒刑、拘役或者管制：

1. 关闭、破坏直接关系生产安全的监控、报警、防护、救生设备、设施，或者篡改、隐瞒、销毁其相关数据、信息的；
2. 因存在重大事故隐患被依法责令停产停业、停止施工、停止使用有关设备、设施、场所或者立即采取排除危险的整改措施，而拒不执行的；
3. 涉及安全生产的事项未经依法批准或者许可，擅自从事矿山开采、金属冶炼、建筑施工，以及危险物品生产、经营、储存等高度危险的生产作业活动的。

从上述规定可以看出，危险作业罪主要针对的是在生产、作业过程中，违反安全管理规定，且具有发生重大伤亡事故或者其他严重后果的现实危险的行为。

超载行为与危险作业罪的关联分析

1. 一般超载情形
   • 如果只是单纯的超载运输，虽然违反了交通运输管理法规，但如果没有达到“具有发生重大伤亡事故或者其他严重后果的现实危险”的程度，一般不构成危险作业罪。例如，超载的车辆在正常行驶过程中，没有出现刹车失灵、车辆失控等可能引发重大事故的紧急危险情况，且超载行为没有对公共安全造成紧迫的、现实的威胁，那么通常不会以危险作业罪论处。
2. 存在重大事故隐患且拒不整改情形
   • 若超载行为存在重大事故隐患，比如车辆严重超载导致制动系统性能大幅下降，随时可能发生刹车失灵等严重问题，且交通运输管理部门依法责令整改（如要求卸载超载货物、对车辆进行维修等），但行为人拒不执行，继续超载运输，此时就可能符合危险作业罪中“因存在重大事故隐患被依法责令……而拒不执行”的情形，从而构成危险作业罪。
   • 在你描述的情况中，虽然每次都卸货了，但如果交通运输管理部门在处罚过程中，明确指出了超载行为存在重大事故隐患，并要求采取其他整改措施（如对车辆进行安全检测、对驾驶员进行安全教育等），而你拒不执行这些整改措施，仍然继续超载运输，那么就有可能构成危险作业罪。
3. 多次超载的累积影响
   • 多次超载被处罚，说明超载行为具有一定的持续性和顽固性。如果这种持续的超载行为不断加剧了车辆的安全隐患，使得发生重大事故的现实危险不断增加，那么也有可能被认定为构成危险作业罪。例如，多次超载导致车辆的轮胎、悬挂系统等部件严重磨损，但仍然不进行维修和整改，继续超载运输，这种情况下就可能因具有发生重大事故的现实危险而构成危险作业罪。

法律建议

1. 严格遵守交通运输法规：超载运输不仅违反法律法规，还会对自身和他人的生命财产安全造成严重威胁。建议你严格遵守交通运输管理法规，按照车辆核定的载质量进行运输，确保行车安全。
2. 积极配合整改措施：如果交通运输管理部门指出你的运输行为存在安全隐患并要求整改，一定要积极配合，及时消除安全隐患。这不仅是为了避免法律责任，更是为了保障自己和他人的安全。
3. 咨询专业法律意见：如果你对自己的行为是否构成危险作业罪存在疑问，或者交通运输管理部门已经对你展开了调查，建议你及时向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律意见和帮助。

总之，超载百吨被交警处罚三次且每次都卸货，是否构成危险作业罪需要综合考虑超载行为的具体情况、是否存在重大事故隐患、是否拒不执行整改措施等因素。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。